用人单位在少扣个税和社保个人部分后更正申报，能否向离职员工追偿，需分情况讨论，法院判决也会因具体案情而有所不同，以下从不同角度进行分析：

1. 若员工对少扣情况不知情且无过错
   • 追偿可能性较低：如果用人单位由于自身财务核算错误、系统故障等原因，导致在员工在职期间少扣了个税和社保个人部分，而员工对此并不知情，且不存在故意或重大过失导致少扣的情况。在这种情况下，用人单位一般难以向离职员工追偿。因为从公平原则和过错责任原则来看，员工没有过错，不应为用人单位的失误承担责任。
   • 法院判决倾向：法院在审理此类案件时，通常会考虑双方的过错程度。若认定员工无过错，可能会驳回用人单位的追偿请求。例如，某公司因财务人员疏忽，连续数月未足额扣除员工社保个人部分，员工对此并不知晓。公司更正申报后向离职员工追偿，法院经审理认为员工无过错，判决公司败诉。
2. 若员工与用人单位存在约定或员工存在过错
   • 存在约定时：如果用人单位与员工在劳动合同或其他协议中明确约定，员工有义务确保个税和社保个人部分的准确扣除，且因员工原因导致少扣的，员工应承担补缴责任。在这种情况下，用人单位在更正申报后向离职员工追偿，有较大的可能性得到法院支持。
   • 员工存在过错时：若员工故意提供虚假信息、隐瞒收入等情况，导致用人单位少扣个税和社保个人部分，那么员工存在明显过错。用人单位更正申报后向其追偿，法院一般会根据员工的过错程度，判决员工承担相应的补缴责任。比如，员工为了少缴纳个税，向用人单位虚报扣除项目，导致少扣税款，用人单位发现后更正申报并追偿，法院会支持用人单位的诉求。
3. 追偿的时效和程序问题
   • 时效方面：用人单位向离职员工追偿个税和社保个人部分，也受到诉讼时效的限制。一般来说，诉讼时效为三年，自用人单位知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。如果超过诉讼时效，用人单位可能会丧失胜诉权。
   • 程序方面：用人单位在追偿前，应先与离职员工进行协商沟通，尽量通过友好方式解决。如果协商不成，用人单位可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向法院提起诉讼。在仲裁和诉讼过程中，用人单位需要提供充分的证据，证明少扣个税和社保个人部分的事实以及员工的过错情况等。

建议：用人单位在日常管理中，应加强财务和社保核算的准确性，避免出现少扣个税和社保个人部分的情况。如果确实发生了少扣的情况，应及时与员工沟通协商解决。对于离职员工，在追偿前要充分考虑各种因素，评估追偿的可行性和风险。如果你有相关的法律问题，可以直接向我咨询。