免于刑事处罚后是否补发工资，需根据个人身份、被采取刑事措施的原因以及单位和劳动合同的具体规定来综合判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、公务员的情况
工资待遇影响：
- 公务员在取保候审、监视居住、被刑事拘留、逮捕期间，停发工资待遇，按本人原基本工资的75%计发生活费。
- 如果最终宣告无罪或免于刑事处罚，且未受到其他党纪政纪处分，停发的工资等相关福利待遇应当补上，同时被采取强制措施期间也会计算工作年限。
特殊情况：
- 若公务员因司法机关的错误被错误羁押，最终被免除刑事处罚，单位应恢复其原工资待遇，并补发被错误羁押期间的工资。
- 若公务员在免于刑事处罚的同时，受到了党纪政纪处分（如警告、记过、降级、撤职等），工资待遇需根据处分种类调整。受到警告处分的，处分期间不得晋升职务和级别，但工资档次不受影响；受到更严厉处分的，会降低工资待遇，此时不补发因处分导致的降低工资部分。
二、非公务员（包括企业单位员工）的情况
一般情况：
- 对于非公务员身份的人员，依据我国相关法律的规定，法院决定免予追究刑事责任的，被羁押期间减发和扣发的工资、奖金、津贴、补贴不予补发。这是因为，非公务员的工资待遇通常受劳动合同和单位规章制度的约束，而法律并未规定在此情况下必须补发工资。
企业误解导致的情况：
- 如果是企业错误地认为员工有犯罪行为，导致员工被采取刑事措施并最终免除刑事处罚，员工有权要求企业恢复其工作并补发工资。因为员工的权益因企业的不当行为受到了损害，企业应当承担相应的赔偿责任。
员工实施犯罪行为后被免除刑事处罚：
- 企业会依据劳动合同约定以及规章制度来处理。若劳动合同或规章制度中明确规定员工实施犯罪行为即便被免除刑事处罚也会受到降薪、停发工资等处理，并且这些规定经过合法程序制定并向员工公示，则企业不补发工资可能具有一定合理性。但企业的处理应当遵循公平合理以及符合法律规定的原则，不能滥用权力随意侵害员工合法权益。例如，如果企业仅因员工被采取刑事措施就停发工资，而最终员工被免除刑事处罚，企业应当补发工资。
三、实际操作建议
了解个人身份和单位规定：
- 首先，需要明确自己的身份（公务员还是非公务员）以及单位的具体规定和劳动合同的约定。这是判断是否补发工资的基础。
收集相关证据：
- 如果认为应当补发工资，需要收集相关证据，如法律文书（判决书、裁定书等）、单位规章制度、劳动合同等，以证明自己的权益。
与单位协商或申请仲裁：
- 在收集到相关证据后，可以与单位进行协商，要求补发工资。如果协商无果，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
总结来说，免于刑事处罚后是否补发工资不能一概而论，而是需要根据具体情况来判断。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。