有罪免除后，原来的工资是否补发需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
因涉嫌犯罪被限制人身自由，最终免除刑事处罚的情况：
- 在此期间，用人单位可以暂时停止劳动合同的履行，并不支付工资。这是因为劳动者因涉嫌犯罪被限制人身自由，无法正常履行工作职责。
- 但如果劳动者最终被免除刑事处罚，用人单位应当恢复劳动关系，并补发被暂停履行劳动合同期间的工资。这是因为免除刑事处罚意味着劳动者没有被认定构成犯罪，其因未上班而遭受的工资损失应当得到补偿。
被追究刑事责任后免除刑事处罚的情况：
- 如果劳动者被追究刑事责任，用人单位有权解除劳动合同，并且无需支付经济补偿。这是因为刑事责任是严重的违法行为，用人单位有权解除与违法者的劳动关系。
- 但如果后来劳动者被免除刑事处罚，劳动者可以与用人单位协商恢复劳动关系。如果协商不成，可以通过劳动仲裁等法律途径解决。若最终恢复劳动关系，工资补发问题需综合考量之前的约定和相关法律规定来确定。这可能包括补发工资的标准、范围以及具体流程等细节问题。
劳动者存在严重违反单位纪律等过错的情况：
- 即使劳动者最终被免除刑事处罚，但如果其存在严重违反单位纪律等过错行为，用人单位可能根据内部规章制度决定不补发工资。这是因为劳动者的过错行为给用人单位造成了损失或不良影响，用人单位有权根据内部规定进行处罚。
举例说明：
- 假设某员工因涉嫌盗窃被刑拘，后经查明无犯罪事实被免除处罚。在此期间，单位停发了其工资。由于该员工并未构成犯罪，单位应当补发其被暂停履行劳动合同期间的工资。
- 另一假设，某员工在上班期间严重违纪，导致单位遭受重大损失。即使该员工后来被免除刑事处罚，单位也可能根据内部规章制度决定不补发其工资。
法律建议：
- 对于劳动者而言，如果因涉嫌犯罪被限制人身自由或受到刑事处罚，最终又被免除刑事处罚，应当及时与用人单位沟通，要求恢复劳动关系并补发工资。如果用人单位拒绝，可以通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
- 对于用人单位而言，在处理此类问题时应当遵循相关法律法规和劳动合同的约定，确保处理结果的合法性和合理性。同时，也应当加强内部管理，预防类似事件的发生。
可能后果：
- 如果用人单位未按照法律规定和劳动合同约定处理工资补发问题，可能面临劳动仲裁或诉讼的风险，需要承担相应的法律责任。
- 如果劳动者未通过合法途径维护自己的权益，而是采取过激行为或违法手段，也可能面临法律责任。
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