结论：员工在本公司上班但保险在另一个公司交，这种行为是否违法需分情况讨论，具体如下：

1. 若两家公司存在关联关系，且符合法律规定
   如果两家公司属于同一集团、母子公司或存在其他关联关系，且社保缴纳符合《社会保险法》及地方规定（例如：员工与实际用工单位存在劳动关系，但因政策或操作便利性，由关联公司代缴社保），这种安排通常不违法。但需满足以下条件：

   • 劳动关系明确：员工与实际用工单位签订劳动合同，接受其管理并从事其安排的工作；
     
   • 社保缴纳合规：代缴公司需具备社保代理资质（如人力资源服务许可证），且社保基数、险种等符合法律规定；
     
   • 书面协议：两家公司及员工之间需签订书面协议，明确社保缴纳的责任主体及权利义务，避免纠纷。
     

2. 若两家公司无关联关系，或存在“挂靠代缴”行为
   如果员工实际在A公司工作，但社保由无关联的B公司缴纳（即“挂靠代缴”），这种行为可能涉嫌违法，具体风险包括：

   • 对员工的风险：
     
     • 社保权益受损：若B公司未按时足额缴纳社保，员工可能无法享受医保报销、养老金领取等权益；
       
     • 劳动关系认定纠纷：发生工伤或离职时，可能因社保缴纳单位与实际用工单位不一致，导致工伤认定、经济补偿等主张被驳回；
       
     • 信用风险：部分地区将“挂靠代缴”纳入征信系统，可能影响员工未来购房、落户等。
       
   • 对公司的风险：
     
     • 行政处罚：根据《社会保险法》第八十八条，以欺诈、伪造证明材料等手段骗取社保待遇的，由社保行政部门责令退回，并处骗取金额2-5倍罚款；
       
     • 劳动纠纷：员工可能以“未依法缴纳社保”为由解除劳动合同，并主张经济补偿；
       
     • 税务风险：若代缴公司未如实申报个税，可能牵连实际用工单位承担连带责任。
       

建议：

• 对员工：若发现社保缴纳单位与实际用工单位不一致，应要求公司出具书面说明，明确社保缴纳主体及责任；若涉及“挂靠代缴”，可向当地社保部门举报。
  
• 对公司：应避免“挂靠代缴”行为，可通过调整用工模式（如劳务派遣、非全日制用工）或与关联公司签订合法代理协议，确保社保缴纳合规。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体细节为您提供更详细的分析。