结论：合同中规定固定加班费是否合法，需根据具体情况判断，关键在于该约定是否足额支付了劳动者的正常工作时间工资，合理反映了劳动者的加班情况及应得报酬，且不违反法律法规的强制性规定。
合法情形及分析
足额支付基础工资：
- 若用人单位与劳动者约定的固定加班费数额是以足额支付正常工作时间工资为基础，且折算后的正常工作时间工资不低于当地最低工资标准，则该约定合法。
- 例子：劳动者正常工作时间工资为每月5000元，合同中约定固定加班费为每月1000元，且该加班费是基于劳动者可能加班的情况合理计算得出，同时确保劳动者实际获得的总收入不低于法定标准，则此约定合法。
合理反映加班报酬：
- 固定加班费应能合理反映劳动者加班情况及应得报酬，即不低于按照法律规定的加班费计算标准所得出的数额。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，延长工作时间、休息日工作和法定休假日工作的，应分别支付不低于工资的百分之一百五十、百分之二百、百分之三百的工资报酬。若固定加班费不低于这些标准计算出的数额，则合法。
双方自愿协商：
- 双方在平等自愿、协商一致的基础上约定固定加班费，且不违反法律法规的强制性规定，该约定合法。
- 分析：自愿协商是劳动合同订立的基本原则，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该约定即有效。
不合法情形及分析
规避法定责任：
- 若用人单位通过约定固定加班费的方式，规避其按照法律规定的加班费计算标准向劳动者支付加班费的义务，则该约定不合法。
- 例子：劳动者在法定节假日加班，按照法定标准应得加班工资为正常工资的三倍，但合同中约定的固定加班费远低于此标准，则该约定不合法。
低于法定标准：
- 劳动者实际获得的加班费低于法定标准，即使合同中有所约定，也因违反法律的强制性规定而无效。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，违反法律、行政法规强制性规定的劳动合同无效或部分无效。因此，约定固定加班费但低于法定标准的条款，可能因违反这些规定而被认定为无效。
排除劳动者权利：
- 约定中排除了劳动者依法应享有的加班费权益，如用固定加班费代替所有的加班补偿等，则该约定不合法。
- 分析：劳动者有权按照实际加班情况获得相应的加班工资，用人单位不得通过约定固定加班费的方式剥夺劳动者的这一权利。
总结与建议
为确保合同中规定固定加班费的合法性，用人单位在与劳动者约定时，应务必确保足额支付正常工作时间工资，并合理反映劳动者的加班情况及应得报酬。同时，双方应在平等自愿、协商一致的基础上进行约定，并确保不违反法律法规的强制性规定。若存在任何疑问或争议，建议及时向我咨询以获取准确的法律意见。