有合同扣钱是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合同中有明确约定扣钱条款，且该条款合法有效：

   • 如果合同中明确规定了在某些情况下（如违约、未履行合同义务等）可以扣除一定金额作为违约金或赔偿，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这种扣钱行为是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。如果合同中明确约定了扣钱条款，且该条款合法，那么当事人应当遵守。

2. 合同中没有明确约定扣钱条款，或者约定不明确：

   • 如果合同中没有明确规定扣钱的情况，或者约定不明确，那么一方擅自扣钱可能构成违约或侵权行为，是不合法的。
   • 法律依据：同样根据《中华人民共和国民法典》，如果合同中没有约定或者约定不明确，且无法通过补充协议或交易习惯等方式确定，那么应当按照有利于实现合同目的的方式履行。擅自扣钱显然不符合这一原则。

3. 扣钱行为违反法律法规的强制性规定：

   • 即使合同中有扣钱条款，但如果该条款违反了法律法规的强制性规定（如扣除的金额超过了法定限额、扣钱的原因不合法等），那么这种扣钱行为也是不合法的。
   • 举例说明：比如，在劳动合同中，用人单位不能随意扣除劳动者的工资作为违约金或赔偿，除非符合法律法规规定的情形（如劳动者给用人单位造成经济损失且需要赔偿等）。

法律建议：

• 在签订合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于扣钱、违约金、赔偿等方面的约定，确保自己的权益不受侵害。
• 如果合同中有扣钱条款，要评估该条款的合法性和合理性，避免因为条款不合法或不合理而导致自己的权益受损。
• 如果遇到一方擅自扣钱的情况，要及时与对方沟通协商，要求对方说明扣钱的原因和依据，并保留好相关证据（如合同、扣钱记录等），以便在必要时通过法律途径维护自己的权益。

可能后果：

• 如果扣钱行为合法且合理，那么被扣钱的一方需要接受并履行合同义务。
• 如果扣钱行为不合法或不合理，那么被扣钱的一方有权要求对方返还扣钱金额，并可能要求对方承担违约责任或赔偿责任。在严重情况下，还可能涉及法律纠纷和诉讼。

总结：有合同扣钱是否合法，取决于合同中的约定以及该约定是否合法有效。在签订合同时，务必谨慎对待扣钱条款，确保自己的权益不受侵害。如果遇到问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。