教师因伤住院，其绩效工资是否全扣需视具体情况而定，并非绝对全扣。以下从不同角度进行分析：
劳动合同与单位规章制度：
- 首先，应查阅教师与学校签订的劳动合同以及学校的规章制度。这些文件中通常会明确规定在教师因伤住院等特殊情况下，工资（包括绩效工资）的支付方式和标准。
- 如果合同或规章制度中有明确规定因伤住院期间绩效工资的支付方式，如按一定比例支付或全额支付，则应按照这些规定执行。
相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者在患病或非因工负伤期间，在规定的医疗期内，用人单位应按不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或疾病救济费。虽然这一条款主要针对的是基本工资，但绩效工资作为工资的一部分，其支付方式也可能受到类似原则的影响，具体需结合地方性法规和单位规章制度。
- 如果教师因伤住院属于工伤范畴，那么根据《工伤保险条例》，教师将享受工伤保险待遇，包括医疗费用报销、停工留薪期工资等。在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付，这通常也包括绩效工资。
实际情况与公平原则：
- 即使合同或规章制度中没有明确规定，从公平原则出发，教师因伤住院并非其个人原因导致，且住院期间无法正常工作，因此全额扣除绩效工资可能显得不合理。
- 学校或教育机构在处理此类情况时，应考虑教师的实际贡献、住院时间的长短以及学校的财务状况等因素，合理确定绩效工资的支付比例或方式。
建议：
- 教师因伤住院后，应及时与学校或教育机构沟通，了解工资支付的具体政策和流程。
- 如果对工资支付有异议，可以查阅相关法律法规和合同条款，必要时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 学校或教育机构也应完善相关规章制度，明确在教师因伤住院等特殊情况下的工资支付方式，以避免不必要的纠纷。
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