结论概述：教师工伤请假期间，绩效工资、课时费及班主任费的扣除情况需依据具体法律法规、学校规章制度及劳动合同约定综合判断。以下从不同角度进行详细分析。
一、法律法规层面
《工伤保险条例》的相关规定：
- 根据《工伤保险条例》，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常包括基本工资、绩效工资等固定收入部分，但具体是否包含课时费和班主任费，需结合地方性法规或学校规章制度进一步明确。
地方性法规或政策：
- 不同地区可能根据实际情况制定了更为详细的工伤保险实施办法或细则，其中可能明确规定了工伤请假期间各项待遇的支付标准。因此，教师需查阅所在地区的相关规定，以确定课时费和班主任费是否应被扣除。
二、学校规章制度层面
学校内部规定：
- 学校作为用人单位，通常会制定内部规章制度来规范教职工的薪酬管理、请假制度等。这些规定可能明确规定了工伤请假期间绩效工资、课时费及班主任费的支付情况。因此，教师需仔细查阅学校的规章制度，了解自己的权益。
劳动合同约定：
- 教师与学校签订的劳动合同中，可能也包含了关于工伤请假期间薪酬支付的条款。如果劳动合同中有明确约定，则应按照合同约定执行。
三、实际操作建议
与学校沟通协商：
- 在工伤请假期间，教师可首先与学校的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解学校对于工伤请假期间薪酬支付的具体政策。如果学校存在不合理扣除的情况，教师可提出异议并寻求协商解决。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果与学校沟通无果，教师可向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求学校按照法律法规和劳动合同约定支付工伤请假期间的薪酬。如果对劳动仲裁结果不满，教师还可向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
四、特殊情况说明
如果课时费和班主任费属于固定薪酬部分：
- 根据《工伤保险条例》及地方性法规的精神，这些费用在工伤请假期间通常不应被扣除。因为它们是教师固定收入的一部分，与教师的正常工作状态密切相关。
如果课时费和班主任费属于奖励性薪酬部分：
- 如果这些费用是根据教师的工作表现、课时量或班级管理情况等额外发放的奖励性薪酬，那么在工伤请假期间，由于教师未能实际履行相关职责，学校可能会根据规章制度或劳动合同约定进行适当扣除。但扣除的比例和方式需合理合法，不得侵犯教师的合法权益。
总结与建议：教师工伤请假期间，绩效工资、课时费及班主任费的扣除情况需综合考虑法律法规、学校规章制度及劳动合同约定。建议教师首先查阅相关法律法规和学校规章制度，了解自己的权益；然后与学校进行沟通协商，寻求合理解决方案；如果协商无果，可申请劳动仲裁或提起诉讼维护自己的合法权益。如有具体疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。