公司与员工协议加班费15元一个小时是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 从加班费支付标准的角度分析：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，加班费支付有明确的标准：延长工作时间应支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日工作且无补休应支付不低于工资的200%的工资报酬；法定休假日工作应支付不低于工资的300%的工资报酬。
   • 若员工的小时工资标准较高，15元/小时的加班费可能低于法定标准。例如，若员工正常时薪为20元，那么延长工作时间的加班费至少应为30元/小时（20元*150%），此时15元/小时的加班费显然不合法。
   • 计算公式：假设员工正常时薪为W元，延长工作时间的加班费至少应为\(W \times 150\%\)元/小时。若协议加班费低于此标准，则不合法。

2. 从工时制度的角度分析：

   • 标准工时制度：若公司实行标准工时制，即每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时，那么超出部分应视为加班，且加班费需按法定标准支付。若协议加班费15元/小时低于法定标准，则不合法。
   • 不定时工作制或综合计算工时工作制：若公司经劳动行政部门批准实行不定时工作制或综合计算工时工作制，且确保劳动者休息休假权利，那么在某些情况下，如计算周期内平均工作时间未超法定标准，且依法支付加班费，可能合法。但即便如此，加班费也需符合法定最低标准，15元/小时是否合法仍需根据员工正常时薪来判断。

3. 特殊情况：

   • 在自然灾害、事故或其他紧急情况下，可能需要紧急处理而延长工作时间。但这些情况需具体分析和判断，且必须确保劳动者身体健康和合法权益不受侵害。即便如此，加班费也需按法定标准支付。

建议：

• 员工应了解自己的正常时薪和加班费支付标准，确保公司支付的加班费不低于法定最低标准。
• 若公司支付的加班费低于法定标准，员工可与公司协商解决，或向当地劳动监察部门投诉举报，甚至申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。

总结：公司与员工协议加班费15元一个小时是否合法，取决于员工的正常时薪、加班时间以及公司实行的工时制度。若加班费低于法定最低标准，则不合法。员工应了解自己的权益，并在必要时依法维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。