行政执法过程中发现跨区域刑事案件的，应当立即将案件移送有管辖权的公安机关处理，并配合做好后续工作。具体处理流程和注意事项如下：

1. 及时移送案件：

   • 行政执法机关在执法过程中，一旦发现涉嫌刑事犯罪且可能涉及跨区域的案件，应当立即停止行政执法行为，避免以行政处罚代替刑事处罚。
   • 根据《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》，行政执法机关应当在24小时内将案件移送同级公安机关，并出具书面移送材料，包括案件来源、查获情况、嫌疑人基本情况、涉嫌犯罪的主要事实、证据材料等。

2. 配合公安机关调查：

   • 移送案件后，行政执法机关应当积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和支持，如提供证据材料、协助抓捕嫌疑人等。
   • 如果公安机关需要进一步了解案件情况或调取相关证据，行政执法机关应当及时响应，确保案件顺利侦破。

3. 跨区域协作机制：

   • 对于跨区域的刑事案件，公安机关之间通常会建立协作机制，如联合侦查、信息共享、证据移交等。
   • 行政执法机关在移送案件时，可以建议公安机关启动跨区域协作机制，以便更高效地推进案件侦破工作。

4. 注意程序合法性：

   • 行政执法机关在移送案件时，必须确保程序合法，如移送材料齐全、符合法定形式、移送时限符合规定等。
   • 如果程序存在瑕疵或违法行为，可能会影响案件的后续处理，甚至导致证据无效或案件被撤销。

5. 后续跟进与反馈：

   • 行政执法机关在移送案件后，可以定期向公安机关了解案件进展情况，但不应干预公安机关的独立侦查权。
   • 如果公安机关对案件作出不予立案决定，行政执法机关认为有错误的，可以申请复议或向人民检察院提出立案监督建议。

示例：假设某市市场监管局在执法过程中发现一起涉嫌生产、销售伪劣产品的案件，且该案件涉及多个省份。市场监管局应当立即将案件移送至本市公安机关，并出具详细的移送材料。同时，市场监管局可以建议公安机关启动跨区域协作机制，与其他省份的公安机关共同侦破此案。在案件侦破过程中，市场监管局应当积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和支持。

温馨提示：行政执法机关在发现跨区域刑事案件时，务必保持高度警惕，确保案件得到及时、有效的处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。