公安机关在办理刑事案件过程中若发现行政案件，应当根据案件性质和法律规定分别处理，具体分为以下两种情形：

1. 刑事案件与行政案件存在关联性，需合并处理
   若行政案件与正在办理的刑事案件存在直接关联（如同一行为同时违反刑法和行政法规），公安机关应优先以刑事案件立案侦查。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第178条，若行政案件的违法事实是刑事案件的组成部分，公安机关应将行政案件转为刑事案件办理，并终止行政案件调查程序。例如，在办理故意伤害刑事案件时，若发现行为人同时存在无证驾驶的行政违法行为，后者需作为刑事案件的情节考量，不再单独作为行政案件处理。

2. 刑事案件与行政案件无关联性，需分别处理
   若行政案件与刑事案件无直接关联（如刑事案件为盗窃，行政案件为交通违章），公安机关应按照“刑行分离”原则处理：

   • 刑事案件优先：根据《刑事诉讼法》第115条，公安机关对刑事案件的侦查具有优先性，需集中资源查明犯罪事实。
     
   • 行政案件移交或继续调查：
     
     • 若行政案件属于公安机关管辖范围（如治安管理处罚法规定的案件），可由同一机关内设的治安部门继续调查，但需确保刑事侦查与行政调查互不干扰；
       
     • 若行政案件不属于公安机关管辖（如市场监管、税务等领域的案件），应依据《行政处罚法》第27条，在刑事侦查终结后将行政案件线索移送有管辖权的行政机关处理。例如，在办理非法经营刑事案件时，若发现行为人同时存在虚假广告的行政违法行为，需将广告违法线索移送市场监管部门。
       

程序衔接要点：

• 证据转化：刑事案件中收集的证据若符合行政案件证据要求（如真实性、合法性、关联性），可直接作为行政案件的证据使用，但需注意刑事证据标准通常高于行政证据标准。
  
• 时效中断：若行政案件因刑事侦查需要中止调查，中止期间不计入行政案件办理期限（《公安机关办理行政案件程序规定》第165条）。
  
• 处罚竞合：若行为人因同一行为同时承担刑事责任和行政责任，行政处罚的种类和幅度需与刑事处罚相协调，避免重复处罚（如已判处罚金的不再并处罚款）。
  

实务建议：
公安机关在处理此类案件时，应严格区分案件性质，避免以刑代行或以行代刑。若对案件定性存在疑问，可依据《公安机关内部执法监督工作规定》启动执法监督程序，或通过联席会议机制与检察院、法院协商，确保程序合法性。

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