结论：车贷逾期后与贷后部门协商一致，能否开具结清证明取决于协商的具体内容以及贷款的实际偿还情况。以下从不同角度进行分析：
一、协商一致且贷款已全额偿还
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人按照约定的期限返还借款的，贷款人应当按照约定提供相关的贷款结清证明。
- 在车贷合同中，一旦借款人按照协商的方案全额偿还了逾期贷款及可能产生的罚息、违约金等费用，贷款人（银行或金融机构）即有义务出具结清证明。
法律建议：
- 在与贷后部门协商时，应明确要求对方在贷款全额偿还后出具结清证明，并确保证明中包含贷款账号、借款人姓名、贷款金额、偿还日期等关键信息。
- 保留好协商过程中的书面记录或录音证据，以备不时之需。
二、协商一致但贷款未全额偿还
法律背景：
- 如果协商的结果是延长还款期限、分期偿还或部分减免债务等，而贷款尚未全额偿还，那么贷款人通常不会出具结清证明。
- 结清证明是贷款完全偿还后的凭证，未全额偿还则无法出具。
法律建议：
- 在这种情况下，应与贷后部门明确协商后的还款计划，并确保按照计划按时还款。
- 可以要求贷后部门出具一份书面协议，明确双方的权利和义务，包括还款金额、还款期限、是否减免债务等关键条款。
- 保留好所有与还款相关的凭证，如转账记录、收据等，以证明自己的还款情况。
三、协商过程中的注意事项
保持沟通：
- 在与贷后部门协商时，应保持积极、诚恳的态度，说明自己的经济情况和还款意愿。
- 及时回应贷后部门的询问或要求，避免因为沟通不畅而导致协商失败。
了解权益：
- 在协商前，应了解自己的合法权益和贷款合同中的相关条款，以便在协商中更好地维护自己的利益。
- 如果对贷款合同或协商方案有疑问，可以咨询专业律师或金融顾问的意见。
谨慎签约：
- 在与贷后部门达成协商一致后，应仔细阅读并理解书面协议的所有条款，确保协议内容符合自己的意愿和实际情况。
- 不要轻易签署自己不理解或不同意的协议条款。
后续行动建议：如果您已经与贷后部门协商一致，并且贷款已经全额偿还，但贷后部门拒绝出具结清证明，您可以向银行或金融机构的客服部门投诉，或者寻求法律途径解决。如果您在协商过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。