当公司制度与劳动法不一致时，应当以劳动法为准，公司制度不得违反劳动法的强制性规定。以下是具体分析和建议：
公司制度与劳动法冲突时的处理原则
根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，且不得违反法律、行政法规及政策规定。若公司制度与劳动法冲突，劳动法具有优先效力，公司制度中违反法律的部分无效，劳动者有权拒绝执行。
劳动者如何应对公司制度违法
- 保留证据：若公司制度存在违法条款（如超时加班、不缴社保、违法调岗降薪等），劳动者应保存制度文件、通知、邮件等证据。
- 沟通协商：可先与公司人力资源部门或上级沟通，明确指出制度违法点，要求修正。
- 投诉举报：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（如未缴社保、拖欠工资等），或申请劳动仲裁（如涉及经济补偿、赔偿金等）。
- 解除合同并索赔：若公司制度违法且严重损害劳动者权益（如强迫劳动、未提供劳动条件等），劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条解除合同，并主张经济补偿。
公司如何避免制度违法风险
- 合规审查：制定或修改制度前，应由法务或律师审核，确保内容符合劳动法、劳动合同法、社会保险法等规定。
- 民主程序：涉及劳动者切身利益的制度（如考勤、薪酬、奖惩等），需履行民主协商程序，并留存会议记录、签字文件等证据。
- 公示告知：制度需通过培训、签字、公告等方式向劳动者公示，确保其知悉并同意。
- 定期更新：根据法律修订（如最低工资标准、休假制度等）及时调整公司制度，避免因滞后导致违法。
温馨提示：若您遇到公司制度违法的情况，可进一步说明具体情形（如制度内容、公司态度等），我会为您分析应对策略及法律风险。