结论：员工患恶性肿瘤且合同到期时，用人单位一般不能直接辞退员工，但具体情形需结合法律规定和实际情况综合判断。 以下是详细分析：

一、医疗期内的保护

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定期限的医疗期。在医疗期内，企业不得解除劳动合同。对于恶性肿瘤这类严重疾病，医疗期通常会相对较长，具体期限需根据员工的实际工作年限和病情确定。

法律建议：

• 员工应了解自己的医疗期期限，并在医疗期内安心治疗，无需担心被辞退。
• 用人单位应遵守医疗期规定，不得在医疗期内解除劳动合同。

二、合同到期时的处理

当劳动合同到期时，如果员工仍在医疗期内，根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当续延至医疗期满。这意味着，即使合同原本到期，用人单位也不能直接终止合同，而需要等待医疗期结束后再做处理。

法律建议：

• 员工在合同到期且仍在医疗期内时，无需担心合同被终止，应专注于治疗。
• 用人单位应依法续延劳动合同至医疗期满，避免违法解除合同的风险。

三、医疗期满后的处理

如果医疗期满后，员工仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。但在此情况下，用人单位需要支付经济补偿金和可能的医疗补助费。

经济补偿金计算：

• 经济补偿金按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
• 公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资

医疗补助费：

• 对于患重病或绝症的员工，用人单位还应增加医疗补助费，患重病的增加部分不低于医疗补助费的百分之五十，患绝症的增加部分不低于医疗补助费的百分之百。

法律建议：

• 医疗期满后，如果员工无法继续工作，用人单位应依法支付经济补偿金和医疗补助费，避免违法解除合同的风险。
• 员工应了解自己的权益，如果用人单位未依法支付经济补偿金和医疗补助费，可以通过法律途径维护自己的权益。

四、特殊情况下的保护

如果员工患恶性肿瘤属于职业病或者因工负伤，那么即使合同到期，用人单位也不能直接终止合同，而需要根据《工伤保险条例》的相关规定进行处理。这通常包括支付工伤医疗待遇、伤残津贴等。

法律建议：

• 如果员工患恶性肿瘤与工作有关，应尽快申请工伤认定，以便享受工伤保险待遇。
• 用人单位应遵守工伤保险规定，不得违法终止与工伤员工的劳动合同。

总结与提醒：员工患恶性肿瘤且合同到期时，用人单位的处理方式需严格遵守相关法律法规。员工应了解自己的权益和法律保护措施，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。