结论前置：在民事调解诉讼中，若判决诉讼费由被告承担，原告有权根据法院的相关规定和流程申请退还预先交纳的诉讼费。以下是对此问题的详细解答：
一、诉讼费用承担原则
根据《诉讼费用交纳办法》第二十九条，诉讼费用原则上由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。在民事调解诉讼中，若调解结果或后续判决明确诉讼费由被告承担，那么被告就应依法负担相应的诉讼费用。这一原则确保了诉讼费用的合理分配，体现了公平正义的原则。
二、退费流程与操作指南
提交申请：
- 原告需在调解协议生效或判决生效后，持生效的法律文书（如调解书、判决书）向法院的诉讼费退费窗口或相关负责部门提出书面退费申请。
- 申请时应填写退费申请表，详细注明案件信息、预交诉讼费金额及要求退费的理由。
法院审核：
- 法院会对原告的退费申请进行审核，确认调解协议或判决中关于诉讼费承担的内容，并核实原告预交诉讼费的凭证和信息。
- 审核过程中，法院会确认申请人的身份和缴费情况，确保退费申请的合法性与准确性。
退费执行：
- 经审核无误后，法院将按照财务规定办理退费手续，并在合理时间内将诉讼费退还给原告。
- 退费的具体时间和方式可能因地区和法院而异，但通常会通过银行转账等方式进行，确保资金的安全与便捷。
三、特殊情况处理
调解结案与诉讼费减半：
- 若案件以调解方式结案，根据《诉讼费用交纳办法》第十五条，诉讼费通常会减半收取。在此情况下，若诉讼费由对方承担，则一般需对方支付减半后的诉讼费金额，原告方可获得退费。
执行问题：
- 若被告未履行调解协议或判决支付诉讼费，可能会影响退费的进度。但原告仍享有依法应获得的退费权利，法院将通过执行程序向被告追缴诉讼费以保障原告权益。在此过程中，原告可以积极配合法院的执行工作，提供必要的协助和信息。
四、注意事项与建议
及时申请：
- 原告应在调解协议生效或判决生效后尽快向法院提交退费申请，避免因拖延而错过申请时机或影响退费进度。及时申请退费有助于原告尽快收回资金，减少经济损失。
材料齐全：
- 在申请退费时，应确保提交的材料完整且准确，包括调解书、判决书、身份证件、缴费票据等。缺失任何材料都可能导致退费申请被延迟或驳回，因此原告应仔细核对所需材料并确保其真实性。
关注法院通知：
- 在退费过程中，原告应密切关注法院的通知和指示，了解退费的最新进度和需要配合的事项。如有任何疑问或问题，应及时与法院沟通解决，以确保退费的顺利进行。
法律依据：
- 《诉讼费用交纳办法》第二十九条：诉讼费用由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。部分胜诉、部分败诉的，人民法院根据案件的具体情况决定当事人各自负担的诉讼费用数额。
- 《诉讼费用交纳办法》第十五条：以调解方式结案或者当事人申请撤诉的，减半交纳案件受理费。
综上所述，当民事调解诉讼费由被告承担时，原告应按照法院的相关规定和流程及时申请退还预先交纳的诉讼费。在申请过程中，应注意材料的完整性和准确性，并密切关注法院的通知以确保退费的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。