法院在判决两个孩子抚养权时，将依据有利于子女身心健康、保障子女合法权益的原则，并综合考量父母的抚养能力、抚养条件、与孩子的感情联系以及品德行为等因素。出轨行为虽可能影响判决，但并非决定性因素。以下是对此问题的详细分析：
一、协商一致的情况
如果男女双方能够就两个孩子的抚养权归属、抚养费支付等问题达成一致意见，法院通常会尊重双方的约定，并在离婚判决书中予以确认。这种情况下，抚养权的判决主要取决于双方的协商结果。
二、无法协商一致的情况
不满两周岁的子女：
- 原则上由母亲直接抚养，这是基于婴儿对母亲的依赖性和母亲在哺乳期的特殊作用。
- 除非母亲存在不利于抚养孩子的情形，如患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，此时父亲可请求直接抚养。
已满两周岁的子女：
- 法院会根据最有利于未成年子女的原则进行判决。
- 考虑因素包括：
- 抚养能力：双方的经济收入、稳定住所和工作稳定性等，这些因素直接关系到孩子未来的生活质量和教育条件。
- 抚养意愿：哪一方更积极主张抚养，并有足够时间和精力陪伴孩子，这体现了父母对孩子的关爱和责任感。
- 生活环境：维持孩子生活环境的稳定对其成长至关重要，因此法院会考虑孩子目前的生活环境以及改变环境可能对其产生的影响。
- 品德和行为：男方出轨可能被视为品德方面的问题，这在一定程度上可能影响其在抚养权判决中的优势，但并非决定性因素。
已满八周岁的子女：
- 应尊重其真实意愿，法院会通过谈话等方式了解孩子的选择，并尽量满足其合理需求。
三、常见的判决结果
一方抚养一个孩子：
- 这种安排较为常见，旨在让孩子都能得到父母双方的关爱和照顾，同时平衡双方的抚养负担。
两个孩子都归一方抚养：
- 可能发生在另一方存在严重过错或无法履行抚养义务的情况下，如一方患有严重疾病、有不良嗜好或无抚养能力等。
- 此外，如果一方能提供更优越的抚养条件，且孩子也愿意跟随其生活，也可能获得两个孩子的抚养权。
特殊情况：
- 针对孩子有特殊需求或父母双方都有严重抚养问题的情况，法院可能会作出其他特殊的抚养安排，以确保孩子的最佳利益和健康成长。
四、出轨行为的影响
出轨行为虽然可能对法院的判决产生一定影响，但它并非决定性因素。法院更关注的是如何确保孩子的最佳利益和健康成长，因此会全面考虑各种因素，包括父母的抚养能力、与孩子的感情联系等。
五、建议
在处理此类问题时，建议你：
- 保持冷静和理性，不要因情绪激动而做出冲动的决定。
- 收集并保存好相关证据，如出轨的证据、双方的抚养能力证明等，以便在法庭上为自己争取更有利的判决。
- 如有需要，可以向我进一步咨询，我会根据你的具体情况提供更具体、更准确的法律建议和帮助。
总之，法院在判决两个孩子抚养权时，会综合考虑多种因素，以确保孩子的身心健康和合法权益得到最大保障。出轨行为虽可能影响判决，但并非决定性因素。在实际操作中，应寻求专业法律建议，以确保自身权益得到充分保护。