在探讨女方出轨且有两个孩子的情况下，法院如何判决孩子抚养权的问题时，我们需要从多个维度进行综合考量。以下是对此问题的详细解答：
一、孩子年龄与抚养权判决
两周岁以下子女：
- 原则上，两周岁以下的子女会随母方生活。
- 但若母方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活，或有抚养条件不尽抚养义务而父方要求子女随其生活等情形，子女可随父方生活。
两周岁以上子女：
- 若父方和母方均要求抚养，法院会综合考虑双方的具体情况。
- 一方若已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力，或子女随其生活时间较长、改变生活环境对子女健康成长明显不利，或无其他子女而另一方有子女等情形，可优先考虑该方抚养。
八周岁以上子女：
- 法院会尊重子女的真实意愿，考虑其希望与哪一方生活。
二、女方出轨对抚养权判决的影响
- 女方出轨虽然属于过错行为，但这并非决定抚养权归属的关键因素。
- 法院在判决抚养权时，会从最有利于未成年子女的原则出发，综合考虑双方的经济条件、生活环境、个人品德等多方面因素。
- 女方出轨可能作为考量其品德的一方面，但不会直接导致抚养权判给另一方。
三、其他考量因素
经济状况：
- 法院会考虑双方的经济能力，以确保子女能够得到稳定的经济支持。
生活环境：
- 子女长期的生活环境、学校、社区等也是法院考虑的重要因素。
教育背景：
- 双方的教育背景、对子女的教育理念等也会影响抚养权的判决。
子女意愿（针对八周岁以上子女）：
- 法院会尊重子女的真实意愿，尽量满足其希望与哪一方生活的愿望。
四、判决结果的可能性
- 在有两个孩子的情况下，法院可能会判决父母双方各自抚养一个孩子，以平衡双方的抚养压力。
- 但这并非绝对，法院仍会结合实际情况，如双方的经济状况、生活环境、教育背景等，做出最有利孩子成长的判决。
- 如果女方存在不适合抚养孩子的情形（如严重不良嗜好、无稳定收入等），而男方抚养条件更优，法院也可能将两个孩子的抚养权都判给男方。
五、后续安排
- 无论抚养权如何判决，另一方都应依法享有探视孩子的权利。
- 双方应就探视时间、方式等达成协议，以确保子女能够得到双方的关爱和照顾。
综上所述，女方出轨且有两个孩子的情况下，法院在判决抚养权时会综合考量多方面因素，以保障子女的最大利益。因此，无法简单地预测判决结果，而需要根据具体情况进行综合分析。