结论：晚上5点到第二天8点半值班，仅给100元加班费是否合法，需根据具体的工作时长、工资基数以及当地的加班费计算标准来判断，但通常情况下，这样的加班费数额很可能不合法。
详细分析
加班时长计算：
- 从晚上5点到第二天8点半，值班时长跨越了夜间和凌晨，总计约为15.5小时。这明显超出了正常的工作日8小时工作制。
加班费计算标准：
- 根据《劳动法》及相关规定，加班费通常按照不低于劳动者正常工作时间工资的百分比来计算。工作日加班一般不低于工资的150%，休息日加班且未安排补休的不低于200%，法定节假日加班的不低于300%。
- 假设劳动者的正常工作时间工资为X元/小时，那么对于这15.5小时的加班，如果按照工作日加班的最低标准（150%）来计算，加班费至少应为\(15.5 \times X \times 150\%\)。如果X是一个相对合理的时薪，那么100元的加班费显然远低于这个数额。
特殊情况考虑：
- 如果这15.5小时中包含了休息时间（如夜间可以休息几小时），或者值班性质并非连续工作（如只是待命状态），那么加班费的计算可能会有所不同。但即便如此，100元的加班费也显得过低。
- 另外，如果劳动者与用人单位之间有特别的约定（如包薪制、综合计算工时制等），且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么加班费的计算可能会按照约定来执行。但即便如此，也需要确保约定合法且公平。
地区差异：
- 不同地区的最低工资标准、加班费计算标准可能存在差异。因此，在判断100元加班费是否合法时，还需要考虑劳动者所在地区的具体规定。
法律建议
- 核实工资基数：劳动者应首先核实自己的正常工作时间工资基数，以便准确计算应得的加班费。
- 了解当地规定：查阅当地关于加班费计算的具体规定，确保自己的权益不受侵害。
- 与用人单位沟通：如果认为加班费不合理，可以与用人单位进行沟通，要求按照法律规定支付加班费。
- 寻求法律援助：如果沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
示例计算（假设时薪为X元）
假设劳动者的时薪为20元，那么按照工作日加班的最低标准（150%）来计算，15.5小时的加班费至少应为：
\(15.5 \times 20 \times 150\% = 465\)（元）
显然，100元的加班费远低于这个数额，因此很可能不合法。
综上所述，晚上5点到第二天8点半值班，仅给100元加班费在大多数情况下是不合法的。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取行动维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。