核心结论：针对农村自建房包工包料时，包工头使用非标钢筋导致损失的情况，赔偿方式需根据具体损失情况、合同约定及法律规定综合确定，一般可通过协商、诉讼等途径要求包工头承担修复费用、赔偿损失等责任。以下是详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 若您与包工头签订的书面合同中明确约定了建筑材料的质量标准，且约定了使用非标材料的违约责任，那么您可直接依据合同条款要求包工头承担违约责任，包括但不限于更换合格材料、修复因非标材料导致的质量问题、赔偿因质量问题造成的损失等。

2. 法定责任承担：

   • 修复与重作：根据《民法典》相关规定，承包人（包工头）交付的工作成果不符合质量要求的，定作人（您）可以合理选择请求承包人承担修理、重作、减少报酬、赔偿损失等违约责任。因此，您有权要求包工头对使用非标钢筋导致的房屋质量问题进行修复或重作。
   • 赔偿损失：若因非标钢筋的使用导致房屋存在安全隐患或无法正常使用，您因此遭受了经济损失（如修复费用、房屋价值减损、因房屋无法使用而产生的额外费用等），您有权要求包工头赔偿这些损失。

3. 证据收集与诉讼准备：

   • 在要求包工头承担责任前，建议您收集相关证据，如合同、付款凭证、非标钢筋的检测报告、房屋质量问题的鉴定报告、因质量问题产生的额外费用凭证等。
   • 若包工头拒绝承担责任，您可考虑通过诉讼途径解决纠纷。在诉讼过程中，上述证据将对您主张权利至关重要。

4. 行政监管与投诉：

   • 您还可以向当地建设行政主管部门或质量监督机构投诉包工头的违法行为，这些部门有权对违法行为进行查处，并可能对您与包工头之间的纠纷进行调解。

行动建议：

• 首先，与包工头进行协商，明确告知其使用非标钢筋的违法性和可能承担的法律责任，要求其按照合同约定或法律规定承担责任。
• 若协商无果，建议您尽快收集相关证据，并考虑咨询专业律师（即向我咨询）以制定更详细的诉讼策略。
• 在诉讼过程中，保持冷静和理性，积极配合法院和律师的工作，以维护自己的合法权益。