夫妻双方签协议时，见证人是女方母亲，该协议并不当然无效，但见证人的身份可能会影响协议的证明力，具体需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
协议有效的基本条件
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效需满足以下条件：
- 行为人具有相应的民事行为能力：夫妻双方作为协议的签订主体，必须具备完全民事行为能力，能够理解协议的内容并承担相应的法律后果。
- 意思表示真实：协议必须是夫妻双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议的内容必须合法，不得违反法律的强制性规定或社会公共利益。
只要协议满足上述条件，即使见证人是女方母亲，协议本身仍然是有效的。见证人的身份并不直接影响协议的法律效力，而是影响协议在证明过程中的可信度。
见证人身份对协议证明力的影响
见证人的中立性：
- 理想的见证人应当是与夫妻双方无利害关系的中立第三方。女方母亲作为见证人，可能因与女方的亲密关系而被认为缺乏中立性。
- 如果协议内容涉及双方财产分割、子女抚养等敏感问题，女方母亲作为见证人可能会引发对方对协议公正性的质疑。
协议的证明方式：
- 如果协议在签订时进行了公证，或者有其他客观证据（如录音、录像等）佐证协议的真实性和合法性，那么见证人的身份对协议证明力的影响将大大降低。
- 如果协议仅依靠女方母亲作为见证人，且没有其他证据佐证，那么在发生纠纷时，对方可能会对协议的真实性提出异议，甚至要求法院对协议进行鉴定或审查。
实际操作建议
选择中立见证人：
- 在签订协议时，尽量选择与夫妻双方无利害关系的中立第三方作为见证人，如律师、公证员或双方共同信任的朋友等。
- 中立见证人能够更客观地见证协议的签订过程，增强协议的可信度。
完善协议形式：
- 除了见证人外，还可以考虑对协议进行公证或录音录像等，以留下客观证据。
- 公证协议具有更强的法律效力，能够在发生纠纷时提供有力的证明。
明确协议内容：
- 协议内容应当明确、具体、无歧义，避免使用模糊或含糊不清的语言。
- 明确双方的权利和义务，以及违约责任等，以减少未来可能发生的纠纷。
总结来说，夫妻双方签协议时见证人是女方母亲，并不直接导致协议无效。但为了确保协议的证明力和可信度，建议选择中立见证人、完善协议形式并明确协议内容。如果你在签订或执行协议过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。