被告在开庭时以鉴定不公为由提出重新鉴定，法院是否会同意，需根据具体情况综合判断。以下从法律原则、实践操作及可能后果三个角度进行详细分析：

一、法律原则层面：重新鉴定的法定条件

根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，当事人对鉴定意见有异议的，可申请重新鉴定，但需满足以下条件之一：

1. 鉴定机构或鉴定人不具备资质：如鉴定机构未列入司法鉴定名录，或鉴定人未取得相应执业资格；
2. 鉴定程序严重违法：如未依法通知当事人到场、未依法封存检材等；
3. 鉴定意见明显依据不足：如鉴定方法错误、数据错误导致结论明显不合理；
4. 其他足以反驳鉴定意见的证据：如新证据显示原鉴定结论与事实不符。

若被告仅以“鉴定不公”为口头主张，未提供初步证据证明存在上述情形，法院通常不会同意重新鉴定。

二、实践操作层面：法院的审查标准

法院在审查重新鉴定申请时，会重点关注以下内容：

1. 异议的合理性：被告需说明原鉴定意见在哪些方面存在错误或瑕疵，而非单纯否定结论；
2. 证据的充分性：被告需提供反驳证据（如专家意见、其他鉴定报告等），证明原鉴定存在法定重新鉴定情形；
3. 诉讼效率考量：若案件已进入庭审阶段，重新鉴定可能导致诉讼拖延，法院会权衡效率与公正，优先选择补充质证或专家辅助人出庭等方式解决争议。

示例：若被告主张“鉴定机构未依法通知其到场参与检材提取”，但未提供现场照片、证人证言等证据，法院可能以“证据不足”为由驳回申请。

三、可能后果层面：申请被驳回或同意的后续程序

1. 申请被驳回：

   • 法院会继续以原鉴定意见作为裁判依据；
   • 被告可申请鉴定人出庭接受质询，或通过专家辅助人出庭发表意见，试图削弱原鉴定意见的证明力。

2. 申请被同意：

   • 法院会委托其他符合资质的鉴定机构重新鉴定；
   • 重新鉴定期间，原诉讼程序可能中止，待新鉴定意见出具后恢复审理；
   • 若新鉴定意见与原意见一致，被告需承担重新鉴定的费用及诉讼拖延的责任。

四、实务建议

1. 提前准备证据：被告应在开庭前收集反驳鉴定意见的证据，避免临时提出申请被驳回；
2. 明确异议焦点：申请重新鉴定时，需具体说明原鉴定意见的错误之处（如数据错误、方法错误等），而非笼统主张“不公”；
3. 考虑替代方案：若重新鉴定条件不充分，可申请鉴定人出庭或专家辅助人出庭，通过交叉询问削弱原鉴定意见的证明力。

总结：被告以鉴定不公为由申请重新鉴定，法院是否同意取决于异议是否符合法定条件、证据是否充分及诉讼效率考量。建议被告在提出申请前，充分评估证据及法律风险，必要时咨询专业律师制定策略。如有进一步问题，可直接向我咨询。