结论：公产房变更承租人仅在网上进行变更而未发放新的租赁合同本，其有效性需根据具体情况来判断，若网上变更流程符合当地公房管理规定且后续补发了书面合同或确认了变更事项，则变更有效；若未满足这些条件，则可能存在效力瑕疵。

分析说明：

1. 网上变更的合法性：

   • 在许多地区，公产房的管理已经实现了电子化或网络化，网上变更承租人可能是当地公房管理部门提供的一种便捷服务方式。
   • 如果网上变更流程符合当地公房管理规定，且该流程本身被设计为具有法律效力（例如，通过电子签名、身份验证等安全措施确保变更的真实性和合法性），那么仅在网上进行变更并不一定导致无效。

2. 书面合同的重要性：

   • 租赁合同是承租人与出租人之间权利义务关系的法律凭证。在公产房租赁中，书面合同通常具有更高的证明力和稳定性。
   • 如果网上变更后未及时发放新的租赁合同本，或者未以书面形式确认变更事项，那么在未来可能因缺乏书面证据而产生纠纷。

3. 实际操作中的建议：

   • 确认变更流程：首先，应确认当地公房管理部门关于网上变更承租人的具体流程和要求，确保变更操作符合规定。
   • 补发书面合同：如果网上变更后未发放新的租赁合同本，建议尽快与公房管理部门联系，要求补发书面合同或获取变更事项的书面确认。
   • 保留证据：在变更过程中，应保留好所有相关的电子证据（如变更通知、确认邮件等），以备不时之需。

4. 可能存在的法律后果：

   • 如果网上变更未满足当地公房管理规定或未补发书面合同，且因此导致纠纷或损失，承租人可能面临无法有效主张自己权利的风险。
   • 在极端情况下，如果出租人否认变更事项或拒绝履行相关义务，承租人可能需要通过法律途径来维护自己的权益。

特殊场景提醒：

• 在某些特殊情况下（如公房管理部门系统故障、政策调整等），网上变更可能暂时无法进行或需要额外步骤来确认变更事项。此时，承租人应密切关注公房管理部门的通知和要求，及时采取相应措施。

行动建议：

• 如果您已经完成了网上变更但尚未收到新的租赁合同本，建议您尽快与公房管理部门联系，确认变更事项并要求补发书面合同。
• 如果您在变更过程中遇到任何问题或疑虑，也可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。