当公司发现员工偷卖了货物时，这是一个严重的违法问题，需要公司从多个方面进行妥善且有效的处理。以下是我为您提供的详细处理建议：

一、立即采取行动并收集证据

1. 保护现场：一旦发现货物被盗卖，公司应立即保护现场，防止证据被破坏或丢失。
2. 收集证据：全面收集相关证据，包括但不限于监控录像（如果有的话）、货物出入库记录、销售记录、目击者证言以及员工行为异常记录等。这些证据对于后续的法律处理和公司内部调查至关重要。

二、内部处理流程与纪律处分

1. 初步调查：公司管理层应安排专门人员或部门展开初步调查，通过询问相关人员、查看工作记录和监控录像等方式，了解货物被盗卖的具体情况。
2. 核实证据：仔细审查收集到的证据，确保事实清楚、证据确凿。
3. 与员工沟通：在掌握一定证据后，与涉事员工进行冷静、理性的沟通谈话，了解其行为动机和背景，并记录谈话内容，要求双方签字确认。
4. 作出处理决定：根据公司规章制度及员工偷卖货物的情节轻重，作出相应的处理决定，如警告、记过、降职、辞退等。处理决定应形成书面文件，并送达给员工本人。
5. 追回货物与赔偿损失：要求员工返还被盗卖的货物或赔偿相应经济损失。如果货物已被转卖无法追回，应要求员工赔偿货物的市场价值或公司因此遭受的损失。

三、法律途径处理

1. 报警与刑事追责：如果员工偷卖货物的行为构成犯罪（如盗窃罪），公司应立即报警，并积极配合公安机关的调查工作。公安机关将立案侦查，并依法追究员工的刑事责任。
2. 民事索赔：员工偷卖货物的行为构成对公司财产权的侵害，公司有权要求员工承担赔偿损失的民事责任。可以与员工协商赔偿事宜，如果协商不成，可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
3. 行政处罚：如果员工偷卖货物的行为尚未达到刑事立案标准，但违反了《治安管理处罚法》等相关法律法规，公司可以向公安机关报案，公安机关将依法对员工进行行政处罚。

四、加强内部管理与预防措施

1. 完善财物管理制度：建立健全的财物管理制度，明确货物管理责任，加强货物出入库的监管和记录。
2. 加强法制教育与道德教育：定期开展法律教育和道德培训，提高员工的法律意识和职业道德水平，增强员工对偷卖货物等违法行为的认知与抵制能力。
3. 加强安保措施：安装监控设备、加强门禁管理等，提高安全防范水平，有效遏制偷卖货物等违法行为的发生。

五、透明公正处理

在处理过程中，公司应保持公正和透明，与相关方进行充分沟通，解释清楚情况和处理决定，确保大家都能理解和接受。这有助于维护公司的形象和声誉，同时也有助于预防类似事件的再次发生。

综上所述，员工偷卖公司货物是一个严重的问题，需要公司采取果断而全面的措施来处理。通过立即采取行动、收集证据、内部纪律处分、法律途径处理以及加强预防和管理措施，我们可以有效地维护公司的财产安全和良好的工作环境。