针对公司员工偷卖公司材料的问题，公司可以采取以下步骤进行处理：

首先，收集并固定证据是关键。公司应尽可能收集监控录像、交易记录、证人证言等，以形成完整的证据链，证实员工的盗窃行为。这些证据将在后续的处理过程中起到至关重要的作用。

其次，依据公司制度进行处理。如果公司规章制度中明确规定了此类盗窃行为属于严重违纪，并且规定了相应的处理措施，如解除合同且无需补偿，那么公司可以依据这些规定来处理该员工。在此过程中，公司应确保处理过程的公正性和合法性，避免引发劳动争议。

接下来，根据盗窃数额和性质决定报警与否。如果员工盗窃的数额较小，不构成犯罪，公司可以要求其返还原料或赔偿损失，并视情况决定是否向公安机关报案，让警方对其进行治安处罚。然而，如果员工盗窃的数额达到当地盗窃罪的立案标准，或者行为性质恶劣，公司应立即报警，由司法机关追究其刑事责任。同时，公司可以通过刑事附带民事诉讼要求员工退赔损失。

此外，注意区分职务侵占与盗窃罪。如果员工是利用职务之便偷卖公司材料，可能构成职务侵占罪。这种情况下，公司应更加重视证据的收集和保存，以便在后续的司法程序中证明员工的犯罪行为。如果员工并未利用职务便利，而是单纯秘密窃取公司材料，则构成盗窃罪。具体定性和量刑由司法机关依实际情况判定。

最后，加强内部管理和预防。公司应以此次事件为鉴，加强内部管理和监督，完善物资管理制度和销售渠道管理，防止类似事件再次发生。同时，公司也可以加强员工教育和培训，提高员工的法律意识和职业道德水平。

综上所述，处理公司员工偷卖公司材料的问题需要公司从多个方面进行综合考虑和处理。在确保证据充分、处理公正合法的前提下，公司应依据相关法律法规和公司制度对员工进行严肃处理，并通过加强内部管理和预防来避免类似事件的再次发生。