在履行行政协议案件中，除了审查合法性外，确实还需要审理协议的效力以及约定的义务是否实际履行。以下是对这一问题的详细分析：

一、审查协议的合法性

合法性审查是履行行政协议案件的基础。这主要包括审查行政协议的主体是否合法、内容是否合法、程序是否合法等方面。例如，行政机关是否具备签订行政协议的法定职权，协议内容是否违反法律法规的强制性规定，以及协议签订过程中是否遵循了法定程序等。合法性审查是确保行政协议具有法律效力的前提。

二、审理协议的效力

1. 效力认定：

   • 在审查行政协议的效力时，需要判断协议是否自成立时即具有法律效力。这通常涉及对协议条款的解读、对法律法规的适用以及可能存在的效力瑕疵（如欺诈、胁迫、重大误解等）的审查。
   • 如果协议存在效力瑕疵，如违反法律法规的强制性规定或损害社会公共利益，则可能被认定为无效或可撤销。

2. 效力瑕疵的处理：

   • 对于无效或可撤销的行政协议，法院将根据具体情况作出相应的判决，如确认协议无效、撤销协议或部分撤销协议等。
   • 同时，法院还可能要求行政机关承担因协议无效或可撤销而产生的法律责任，如赔偿损失等。

三、审理约定的义务是否实际履行

1. 履行情况的审查：

   • 在履行行政协议案件中，法院需要审查行政机关和相对人是否按照协议约定履行了各自的义务。这包括审查履行的时间、方式、内容等是否符合协议约定。
   • 如果一方未按照协议约定履行义务，则可能构成违约，需要承担相应的法律责任。

2. 违约责任的认定：

   • 对于违约行为，法院将根据协议约定和法律法规的规定，认定违约方应承担的违约责任。这可能包括继续履行、采取补救措施、赔偿损失等。
   • 在认定违约责任时，法院会综合考虑违约方的过错程度、违约行为的性质、后果以及相对人的损失等因素。

四、综合考量与判决

在履行行政协议案件中，法院会综合考量协议的合法性、效力以及约定的义务是否实际履行等因素，作出公正、合理的判决。如果行政机关或相对人存在违法行为或违约行为，法院将依法追究其法律责任，以维护行政协议的严肃性和权威性。

建议：在涉及履行行政协议案件时，建议当事人及时咨询专业律师，以便更好地了解自身权益和义务，以及可能面临的法律风险和后果。同时，当事人也应积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和材料，以便法院能够全面、准确地了解案件情况并作出公正判决。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。