公司不按既定的项目经理提成制度计算提成，属于违反内部规章制度或劳动合同约定的行为，员工有权通过协商、投诉或法律途径维护自身权益。以下是具体分析和建议：

1. 核查制度依据与合同约定

• 制度合法性：首先确认提成制度是否通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示等），且内容不违反《劳动法》《劳动合同法》等强制性规定（如最低工资标准、加班费等）。若制度本身违法，员工可主张无效。
• 合同约定：检查劳动合同或补充协议中是否明确约定了提成计算方式、发放条件等条款。若合同有约定而公司未履行，构成违约。

2. 收集证据链

• 书面证据：保留提成制度文件、劳动合同、项目合同、业绩完成证明（如验收报告、客户确认单）等。
• 沟通记录：保存与公司沟通提成问题的邮件、聊天记录、录音等，证明公司未按制度执行。
• 证人证言：若有同事知晓制度内容或同样遭遇，可请其出具书面证言。

3. 协商与投诉

• 内部协商：以书面形式向公司提出异议，要求按制度补发提成，并留存送达证据（如邮件、快递回执）。
• 劳动监察投诉：向当地劳动保障监察大队投诉，提交证据要求公司改正。监察部门可责令公司支付拖欠的提成，并可能处以罚款。

4. 申请劳动仲裁

• 仲裁请求：若协商、投诉无果，可在1年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张：
  1. 公司支付拖欠的提成及利息；
  2. 若公司违法解除合同（如以“不配合”为由开除），可要求赔偿金；
  3. 其他因公司违约导致的损失（如奖金、年终奖等）。
• 仲裁优势：仲裁裁决具有法律效力，公司不履行可申请法院强制执行。

5. 诉讼途径

• 若对仲裁结果不服，可在15日内向法院起诉。诉讼程序更严格，但证据充分时胜诉概率较高。

6. 注意事项

• 时效性：劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道权益受损之日起计算。
• 避免被动离职：若公司以“不配合”等理由开除，务必要求出具书面解除通知，否则可能被认定为违法解除。
• 集体维权：若多名员工遭遇同类问题，可推选代表处理，降低维权成本。

建议行动步骤：

1. 立即整理所有证据；
   
2. 向公司发送书面异议函；
   
3. 同时向劳动监察部门投诉；
   
4. 若未解决，尽快申请劳动仲裁。
   

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