若单位出台内部文件，要求按照企业方式给事业编人员发放工资，这种做法通常是不符合现行法律规定的，事业编人员的工资发放应遵循事业单位的工资制度。以下从多个角度为你详细分析：

事业单位工资制度依据

事业单位实行的是不同于企业的工资制度，其工资构成、调整机制等都有明确规定。根据《事业单位人事管理条例》以及相关的事业单位工资政策，事业单位工作人员的工资包括基本工资、绩效工资和津贴补贴等部分。基本工资有全国统一的岗位工资和薪级工资标准，这是由国家根据事业单位的特点和工作人员的劳动付出等因素综合确定的，旨在保障事业单位工作人员的基本生活和工作积极性。

单位做法的违法性分析

1. 违反工资制度规定：单位自行按照企业方式发放工资，可能改变了基本工资、绩效工资等的构成和比例，或者随意降低了工资标准，这明显违反了国家关于事业单位工资制度的规定。例如，企业可能更侧重于绩效工资的占比，根据企业的经营效益和员工个人业绩来发放工资，而事业单位的基本工资有其固定的标准和调整机制，不能随意套用企业的模式。
2. 损害员工合法权益：这种做法直接损害了事业编人员的合法权益。事业编人员基于对事业单位工资制度的信任和预期，选择了该职业。单位擅自改变工资发放方式，可能导致员工的收入减少，影响其生活质量和职业稳定性。比如，原本按照事业单位工资制度，员工可以享受到稳定的工资增长和相应的福利待遇，而按照企业方式发放工资后，这些权益可能无法得到保障。

应对措施

1. 与单位沟通协商：首先，你可以尝试与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解单位出台该内部文件的具体原因和依据。在沟通中，明确指出单位的做法违反了国家关于事业单位工资制度的规定，要求单位恢复按照事业单位工资制度发放工资。可以引用相关的法律法规和政策文件，如《事业单位人事管理条例》等，增强自己的说服力。
2. 向主管部门反映情况：如果与单位沟通协商无果，你可以向事业单位的主管部门反映情况。主管部门有责任对下属事业单位的管理进行监督和指导，对于单位违反规定的行为，主管部门应当进行调查和处理。在反映情况时，要提供详细的证据，如单位的内部文件、工资发放记录等，以便主管部门能够准确了解问题的实质。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果通过上述途径仍无法解决问题，你可以考虑申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼。劳动仲裁是一种相对快捷、经济的解决劳动争议的方式，由劳动争议仲裁委员会对争议进行裁决。如果对仲裁结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。在申请劳动仲裁或提起诉讼时，要准备好相关的证据材料，如劳动合同、工资条、单位的内部文件等，以证明单位的违法行为和自己的损失。

总之，单位按照企业方式给事业编人员发放工资的做法是不合法的，你有权维护自己的合法权益。如果遇到这种情况，不要惊慌，可以通过与单位沟通协商、向主管部门反映情况、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来解决问题。如果你还有其他疑问或需要进一步的帮助，随时都可以问我。