全额拨款的事业编员工单位按企业管理发工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若单位与员工有明确约定或规章制度规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系时，应当明确约定劳动报酬、支付方式等关键条款。若全额拨款的事业单位在招聘时或后续通过合法程序（如职工代表大会讨论通过）制定了规章制度，明确规定事业编员工的工资发放方式参照企业管理模式，且该约定或制度不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种工资发放方式是合法的。
   • 举例：某全额拨款事业单位，在招聘时明确告知应聘者，其工资将按照企业的绩效考核方式发放，应聘者接受并签订了劳动合同。在此情况下，单位按企业管理发工资是合法的。

2. 若单位与员工无明确约定或规章制度规定，且未遵循事业单位工资管理规定：

   • 全额拨款的事业单位，其经费来源主要依靠国家财政拨款，员工的工资发放通常应遵循国家关于事业单位工资管理的相关规定。若单位未经合法程序，擅自改变工资发放方式，未按照事业单位工资标准或规定发放工资，而是参照企业管理模式，这种做法可能缺乏法律依据，甚至可能构成违法。
   • 法律后果：员工有权向单位提出异议，要求按照事业单位工资管理规定发放工资。若单位拒绝改正，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如事业单位进行改革或转型，可能需要调整工资发放方式。但这种情况下，调整应当遵循法定程序，如经过职工代表大会讨论通过、报相关部门批准等。若未经合法程序擅自调整，同样可能构成违法。

建议：

• 对于全额拨款的事业编员工而言，若对单位的工资发放方式有疑问或不满，首先应查阅自己的劳动合同和单位的规章制度，了解是否有相关约定或规定。
• 若无明确约定或规定，或认为单位的做法违反了事业单位工资管理规定，建议与单位进行沟通协商，寻求解决方案。
• 若沟通无果，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

总结：全额拨款的事业编员工单位按企业管理发工资是否合法，取决于是否有明确约定或规章制度规定，以及是否遵循了事业单位工资管理的相关规定。如有疑问或不满，建议及时咨询并采取措施维护自己的权益。