结论：在不动产证没有撤销的情况下，直接签订协议过户是存在法律风险的，通常不建议这样做。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律程序与规定
不动产登记制度：
- 根据我国《不动产登记暂行条例》及相关法律法规，不动产的转让、变更等应当依法进行登记，未经登记，不发生物权效力。这意味着，即使双方签订了过户协议，如果未完成不动产登记，房屋的所有权并未实际转移。
不动产证撤销与过户：
- 不动产证的撤销通常涉及法律纠纷或行政程序，如法院判决撤销、行政机关依法撤销等。在不动产证未被撤销前，其作为房屋所有权的法律凭证仍然有效。
- 若要在不动产证未撤销的情况下进行过户，理论上需要原产权人配合，且过户行为需符合法律法规的规定，如不存在法律禁止转让的情形（如被查封、抵押等）。但实际操作中，这种过户可能面临诸多法律障碍和风险。
二、法律风险与后果
合同效力问题：
- 如果双方签订的过户协议违反了法律法规的强制性规定（如未经原产权人同意、存在法律禁止转让的情形等），则该协议可能被认定为无效合同。
- 即使协议有效，如果因不动产证未撤销导致过户无法完成，买方可能面临无法取得房屋所有权的风险，同时可能因违约而承担法律责任。
产权纠纷风险：
- 在不动产证未撤销的情况下进行过户，可能引发原产权人与新买方之间的产权纠纷。例如，原产权人可能主张过户行为无效，要求恢复原状或赔偿损失。
- 如果房屋存在其他共有人或利害关系人，过户行为还可能侵犯他们的合法权益，引发更复杂的法律纠纷。
三、建议与操作
合法途径解决：
- 如果希望完成房屋过户，建议首先通过合法途径解决不动产证撤销的问题。例如，与原产权人协商、通过法律程序申请撤销不动产证等。
- 在不动产证撤销后，再按照法律法规的规定进行过户登记，以确保过户行为的合法性和有效性。
谨慎签订协议：
- 在不动产证未撤销的情况下，如果双方仍希望签订过户协议，应谨慎对待协议条款的约定。建议明确约定过户的条件、时间、违约责任等内容，以降低法律风险。
- 同时，建议咨询专业律师的意见，确保协议内容合法合规，并充分了解可能面临的法律风险和后果。
进一步思考：在处理此类房产问题时，除了关注不动产证的撤销与过户问题外，还应全面考虑房屋的其他法律状况（如是否存在抵押、查封等限制转让的情形）、双方当事人的真实意愿和合法权益等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。