结论：退休时发现档案年龄大，已经多上了两年班，一般情况下不需要退还已领取的工资。但具体是否需要退还，还需结合实际情况和相关法律规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、档案年龄与实际年龄不符的法律后果
档案年龄与实际年龄不符，通常是由于历史原因或档案记录错误导致的。在劳动法律关系中，退休年龄一般以档案年龄为准。如果档案年龄大于实际年龄，导致您多上了两年班，这并不意味着您需要退还已领取的工资。因为您在这两年中确实为单位提供了劳动，单位也按照约定支付了工资，这是双方履行劳动合同的正常表现。
二、工资支付的法律原则
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，只要您为单位提供了劳动，单位就有义务支付相应的工资。因此，在您多上的两年班中，单位已经按照约定支付了工资，您无需退还。
三、特殊情况下的处理
虽然一般情况下不需要退还工资，但也存在一些特殊情况。例如，如果单位能够证明您在入职时故意隐瞒了真实年龄，且这一隐瞒行为对单位的招聘决策产生了重大影响，单位可能会主张您退还部分或全部工资。然而，这种情况在实践中较为罕见，且需要单位提供充分的证据来支持其主张。
另外，如果由于档案年龄错误导致您多享受了某些福利待遇（如社保缴纳年限、住房公积金等），且这些福利待遇的享受与档案年龄直接相关，那么您可能需要根据相关规定进行相应的调整或退还。但这并不涉及工资的退还问题。
四、建议与注意事项
核实档案年龄：首先，建议您核实自己的档案年龄和实际年龄，确保档案记录的准确性。如果发现档案年龄有误，可以及时向相关部门申请更正。
与单位沟通：如果您对工资退还问题存在疑虑或担忧，可以与单位进行沟通，了解单位的立场和态度。在沟通过程中，您可以提供相关证据来支持自己的观点。
寻求法律帮助：如果与单位沟通无果或您认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为您提供法律咨询和代理服务，帮助您维护自己的合法权益。
最后，退休时发现档案年龄大且已经多上了两年班的情况下，一般情况下不需要退还已领取的工资。但具体是否需要退还还需结合实际情况和相关法律规定来综合判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。