结论：要求迟到员工写保证书并附加“违法以上一项自动离职”的条款，其合法性需分情况讨论，但通常这类条款存在较大的法律风险，可能被认定为无效。
详细分析：
保证书的性质与效力：
- 保证书本身，如果内容合法、自愿签署，且不违反法律法规的强制性规定，通常具有一定的法律效力。它代表了员工对某种行为或状态的承诺。
- 然而，当保证书与“自动离职”等严厉后果挂钩时，其合法性就受到了质疑。因为“自动离职”通常意味着员工在未经过法定程序（如提前通知、协商等）的情况下，单方面解除劳动合同，这可能损害员工的合法权益。
“违法以上一项自动离职”条款的合法性：
- 这类条款往往被视为对员工的一种严厉惩罚，且可能违反了《劳动合同法》中关于劳动合同解除的规定。根据《劳动合同法》，劳动合同的解除应当遵循法定程序，如双方协商一致、提前通知、支付经济补偿等。
- 如果用人单位仅凭员工的一次迟到或其他轻微违规行为，就依据此类条款单方面解除劳动合同，很可能被认定为违法解除，需要承担相应的法律责任，如支付赔偿金等。
实际操作中的风险：
- 即使员工签署了包含此类条款的保证书，但在实际发生争议时，法院或劳动仲裁机构往往会根据法律法规的强制性规定，以及劳动合同的公平、合理原则，来判定此类条款的效力。
- 如果此类条款被认定为无效，那么用人单位就不能依据其来解除劳动合同，否则将面临法律风险。
法律建议：
对于用人单位：
- 避免在劳动合同或保证书中设置过于严厉或不合法的条款，如“自动离职”等。
- 在处理员工违规行为时，应遵循法定程序，如提前通知、协商、支付经济补偿等，以维护双方的合法权益。
对于员工：
- 在签署任何文件前，应仔细阅读并理解其内容，特别是关于劳动合同解除、违约责任等关键条款。
- 如果对文件内容有疑问或不满，应及时与用人单位沟通或咨询专业律师，以避免不必要的法律风险。
后续行动建议：
- 如果您作为员工，已经签署了包含此类条款的保证书，并担心其可能带来的法律风险，建议您及时咨询专业律师，了解您的权益和可能的法律救济途径。
- 如果您作为用人单位，正在考虑设置此类条款，建议您先咨询专业律师，以确保条款的合法性和有效性，避免未来可能发生的法律纠纷。
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