迟到三次自动离职是否合法，这并非一个简单的是非问题，而是需要结合具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是我从多个角度为你进行的分析：
一、公司规章制度的角度
规章制度的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。因此，公司规章制度是判断迟到三次是否足以导致自动离职（即辞退）的重要依据。
- 规章制度必须经过民主程序制定，即与工会或职工代表平等协商确定，并向劳动者公示或告知。如果规章制度未经合法程序制定或未向劳动者公示，那么它可能不具备法律效力，公司以此为由辞退员工将缺乏法律依据。
规章制度的内容合理性：
- 规章制度中应明确规定何种行为构成严重违反公司制度，包括迟到三次是否属于此类行为。如果规章制度对迟到的处理过于严苛，如未考虑不可抗力因素导致的迟到，可能被视为显失公平，从而影响其合法性。
二、迟到行为的严重性评估
- 在判断迟到三次是否足以导致自动离职时，还需考虑迟到行为对公司的实际影响。如果员工的迟到行为对公司的正常运营造成了严重影响，如导致生产线停滞、错过重要商务谈判等，那么公司依据规章制度辞退员工可能更具合理性。
- 然而，如果迟到仅为轻微的、偶尔的几分钟，且未对工作造成实质影响，公司直接以此为由辞退员工可能显得过于严苛，缺乏合理性。
三、无规章制度或规章制度不合法的情况
- 如果公司没有明确的规章制度规定迟到三次属于严重违反公司制度，或者虽然有这样的规定但未经合法程序制定或未向劳动者公示，那么公司以迟到三次为由辞退员工将缺乏法律依据，属于违法解除劳动合同。
四、员工权利及应对措施
要求说明理由：
- 员工有权要求公司出具书面的辞退通知，并详细说明辞退的具体原因和依据。如果公司无法提供合法有效的依据，员工可以拒绝接受辞退决定。
协商解决：
- 员工可尝试与公司进行协商，说明迟到的具体情况，争取理解，并探讨继续留在公司工作的可能性。如果协商一致，双方可以签订相关协议明确权利义务。
劳动仲裁与诉讼：
- 如员工认为公司的辞退行为违法，可在一年内申请劳动仲裁。在仲裁过程中，员工需提供劳动关系证据及证明自己迟到情况不足以导致辞退的相关证据。
- 若仲裁认定公司辞退违法，员工可获得恢复劳动关系或相应赔偿金（一般为半个月工资标准，具体根据实际情况和当地规定确定）。如对仲裁结果不满，员工还可提起诉讼进一步维护自己的合法权益。
五、经济补偿问题
合法辞退无补偿：
- 如果公司能证明员工在试用期内不符合录用条件或严重违反公司规章制度，且辞退行为合法，则无需支付经济补偿。
非法辞退需赔偿：
- 如果公司无法证明员工不符合录用条件或辞退行为违法，则需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。
总结与建议：
- 迟到三次自动离职是否合法，取决于公司规章制度的合法性、内容的合理性、迟到行为的严重性评估以及公司执行辞退时的法定程序等多个因素。
- 作为员工，如果遭遇不公正的辞退决定，应了解自己的权益和义务，及时采取应对措施维护自己的合法权益。
- 作为公司，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保辞退行为的合法性与合理性，避免不必要的法律风险。
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