公司股东贪污上千万属于严重的违法犯罪行为，应立即采取法律手段进行追责与处理，具体处理方式如下：
刑事报案与立案侦查
- 报案主体：公司作为受害方，应立即向公安机关经济犯罪侦查部门报案，提交股东贪污的初步证据（如财务记录、转账凭证、合同文件等）。
- 罪名认定：股东利用职务便利侵占公司财产，可能涉嫌职务侵占罪（《刑法》第271条）或挪用资金罪（若资金未被非法占有）。若股东为国家工作人员，还可能构成贪污罪（《刑法》第382条）。
- 立案标准：职务侵占罪的立案追诉标准为数额在6万元以上，上千万金额已远超“数额巨大”标准（通常为100万元以上），可能面临三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；若数额特别巨大（如超过1500万元），可能面临十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。
民事追偿与资产保全
- 提起民事诉讼：公司可同时向法院提起民事诉讼，要求股东返还贪污款项及赔偿损失。需准备证据证明股东的侵权行为与公司损失之间的因果关系。
- 申请财产保全：为防止股东转移资产，可在诉讼前或诉讼中向法院申请冻结其银行账户、房产、股权等财产，确保后续执行可行性。
- 股东连带责任：若其他股东或高管参与共谋，可追究其连带赔偿责任；若公司治理存在漏洞（如未履行审计义务），可能需承担部分管理责任，但不影响对贪污股东的追责。
公司内部治理与合规整改
- 启动内部调查：成立独立调查委员会，核查贪污行为的具体手段、涉及人员及资金流向，固定证据链。
- 修订公司章程：明确股东权利边界，强化财务审批流程（如实行双签制、引入外部审计），建立反贪污机制（如设立举报渠道、匿名调查制度）。
- 股东会决议：通过股东会决议罢免涉事股东的职务，并依据《公司法》及章程规定，限制其分红权、表决权等权利，直至其承担法律责任。
行政监管与行业惩戒
- 向监管部门举报：若公司为上市公司或涉及特定行业（如金融、医疗），需向证监会、银保监会等部门报告，可能触发行政处罚（如罚款、市场禁入）。
- 行业黑名单制度：涉事股东若被刑事处罚，可能被列入行业黑名单，限制其未来担任公司高管或参与同类业务。
行动建议：
- 优先委托刑事律师协助报案，确保证据合法性；同步委托民事律师准备诉讼材料，实现刑事追责与民事赔偿并行。
- 若股东已潜逃，可申请“红色通缉令”或通过国际刑事司法协助追逃。
- 处理过程中需注意保密，避免引发公司股价波动或客户信任危机。
如有进一步证据或具体场景（如股东是否为控股股东、贪污手段是否涉及虚构交易等），可提供细节以便更精准分析。