关于您提出的“导师扣发毕业证是否违法”的问题，这确实是一个涉及学生权益的重要议题。首先，我们需要明确的是，任何单位或个人，包括导师，都没有权利非法扣留学生的毕业证。
毕业证是学生完成学业、达到毕业要求后，由学校颁发的证明其学历和学位的法定证件。它不仅是学生学术成就的象征，也是学生未来求职、升学等的重要依据。因此，毕业证的发放在法律上有着严格的规定和保护。
从法律角度来看，导师扣发毕业证的行为可能构成对学生合法权益的侵犯。如果导师因为个人原因或不当理由（如学生未满足其某些非正式要求、个人恩怨等）而扣发毕业证，这显然是不合法的。学生有权向学校相关部门（如教务处、学生处等）提出申诉，要求学校介入调查并解决问题。
此外，如果导师的行为涉及更严重的违法或犯罪行为（如索贿、受贿等），学生还可以向公安机关报案，寻求法律援助和保护。
在实际操作中，我建议您：
与导师进行沟通：首先尝试与导师进行友好、理性的沟通，了解扣发毕业证的具体原因，并寻求解决方案。
向学校相关部门申诉：如果沟通无果，您可以向学校教务处、学生处等相关部门提出申诉，要求学校介入调查并解决问题。
寻求法律援助：如果导师的行为涉及违法或犯罪行为，您可以向公安机关报案，并寻求法律援助和保护。
总之，导师扣发毕业证的行为是不合法的，学生有权维护自己的合法权益。希望您能够采取合适的措施，解决问题并顺利获得毕业证。