追缴公积金不一定必须通过仲裁，具体要看实际情况和诉求处理方式。以下分情况为你详细说明：

1. 若仅要求补缴公积金，通常无需仲裁

公积金补缴属于行政范畴，根据《住房公积金管理条例》，单位不缴或少缴公积金的，由住房公积金管理中心责令限期缴存。因此：

• 直接向公积金中心投诉：携带工资流水、劳动合同、社保记录等证据，证明实际用工单位与公积金缴纳单位不一致，要求公积金中心核查并责令单位补缴。
• 公积金中心处理流程：公积金中心会调查核实，若确认单位违法，会发出《责令限期缴存通知书》，单位需在规定时间内补缴。若单位拒不执行，公积金中心可申请法院强制执行。

2. 若需确认劳动关系或存在其他纠纷，可能需仲裁

如果工资流水与劳动合同单位不一致，且涉及以下情况，可能需要先通过劳动仲裁确认劳动关系，再追缴公积金：

• 单位否认劳动关系：例如，实际用工单位与合同单位为关联公司，但合同单位否认用工事实，此时需通过仲裁确认劳动关系，再凭仲裁裁决向公积金中心投诉。
• 涉及工资、加班费等争议：若追缴公积金的同时，需主张工资差额、加班费等，这些属于劳动争议范畴，需先申请仲裁，再凭仲裁结果处理公积金问题。
• 单位已注销或无法联系：若合同单位已注销或无法联系，可能需通过仲裁确认实际用工单位承担责任，再向公积金中心投诉。

3. 操作建议

• 优先投诉公积金中心：若劳动关系明确，直接向公积金中心投诉效率更高，无需经过仲裁程序。
• 准备充分证据：包括工资流水、劳动合同、社保记录、工作证、考勤记录等，证明实际用工关系。
• 咨询专业意见：若情况复杂（如涉及关联公司、劳务派遣等），建议先梳理证据链，再决定是否需要仲裁。

总结：工资流水与合同单位不一致时，追缴公积金的路径取决于是否需要确认劳动关系或解决其他劳动争议。若仅需补缴公积金，直接向公积金中心投诉即可；若涉及劳动关系确认或其他纠纷，可能需先仲裁。如有具体证据或情况，可进一步向我咨询，我会帮你分析最优处理方案。