结论前置：违章建筑的租金合同效力需根据具体情况分析，一般情形下合同无效，但也有例外情况。以下是对该问题的详细分析：
一、违章建筑租金合同的一般效力
合同无效的情形：
- 根据《最高人民法院关于审理城镇房屋租赁合同纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》第二条，出租人就未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定建设的房屋，与承租人订立的租赁合同无效。这意味着，如果房屋是违章建筑，那么其租金合同在法律上通常被视为无效。
- 违章建筑通常指的是未经规划土地主管部门批准，未领取建设工程规划许可证或临时建设工程规划许可证，擅自建筑的建筑物和构筑物。由于这类建筑缺乏合法的建设手续，因此其租赁合同在法律上难以得到保护。
例外情况：
- 尽管违章建筑的租金合同在一般情况下无效，但也存在例外。例如，如果在一审法庭辩论终结前，出租人能够取得建设工程规划许可证或者经主管部门批准建设，那么租赁合同可以被认定为有效。这体现了法律对事实变化的灵活应对，以及对当事人合法权益的保护。
二、合同无效后的处理
房屋占有使用费：
- 即使租赁合同无效，承租人如果实际使用了房屋，仍需向出租人支付房屋占有使用费。这一费用的标准通常可以参照合同约定的租金进行确定。这是基于公平原则，对承租人实际使用房屋的一种合理补偿。
损失赔偿：
- 合同无效后，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。如果双方都有过错，那么应当各自承担相应的责任。例如，如果出租人明知房屋是违章建筑仍出租，而承租人不知情，那么出租人可能需承担主要赔偿责任。反之，如果承租人在签订合同时未尽到合理审查义务，知道或应当知道房屋是违章建筑仍签订合同，那么双方可能会根据各自过错程度分担损失。
三、特殊情况下的合同效力及处理
租赁房屋在租赁期间被拆除：
- 如果租赁房屋在租赁期间因行政机关作出拆除决定等导致承租人不能继续使用，那么出租人应当承担违约责任，除非当事人另有约定。这是基于合同法的相关规定，对承租人合法权益的一种保护。
租赁物部分或全部毁损、灭失：
- 如果租赁物部分或全部毁损、灭失，且该情形系不可归责于双方当事人的事由导致的，那么承租人可以请求减少租金或者不支付租金。如果因此不能实现合同目的，承租人还可以解除合同。这是基于合同法中关于合同解除和租金调整的相关规定。
预约合同的情况：
- 如果以房屋为标的的租赁合同为预约合同，即使未取得建设工程规划许可证，也不影响预约合同的效力。预约合同是双方为将来订立确定性合同而达成的合意，其效力不受后续本约合同合法性的影响。
四、建议与指导
- 审查房屋合法性：在租赁房屋时，务必仔细审查房屋的合法性，包括是否取得建设工程规划许可证、是否为临时建筑及其使用期限等。这是避免陷入违章建筑租赁合同纠纷的关键。
- 及时咨询法律意见：如果遇到违章建筑租赁合同相关问题，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见和解决方案。作为专业律师，我将根据您的具体情况，为您提供全面的法律服务和支持。
综上所述，违章建筑的租金合同效力及后续处理问题较为复杂，需根据具体情况进行分析和处理。在实际操作中，建议当事人谨慎行事，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善保护。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。