在劳动纠纷中，关于“存在劳动关系由谁举证”的问题，一般遵循“谁主张，谁举证”的原则，但在特定情形下，举证责任会倒置给用人单位。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般原则：“谁主张，谁举证”
劳动者主张存在劳动关系：
- 劳动者需要承担初步的举证责任，以证明其与用人单位之间存在劳动关系的可能性。
- 提供的证据应尽可能直接、充分，包括但不限于书面劳动合同、工资支付凭证或记录（如银行流水、工资条）、工作证件（如工作证、服务证）、考勤记录、社会保险缴纳记录、其他劳动者证言等。
- 若无法提供书面合同，劳动者还可以通过同事证言、工作邮件、微信聊天记录等间接证据来证明事实劳动关系的存在。
用人单位主张不存在劳动关系：
- 若用人单位否认劳动关系的存在，则需要承担相应的反驳举证责任。
- 用人单位需要提供证据来推翻劳动者所主张的劳动关系事实，例如提供员工名册、工资发放记录、社保缴费记录、招用记录等，以证明劳动者并非其员工或所主张的“工资”并非基于劳动关系的劳动报酬。
二、特殊情形：举证责任倒置
用人单位掌握管理关键证据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条，当涉及工资支付记录、考勤记录、招聘登记表等由用人单位保管的证据时，若劳动者已提供初步证据（如工牌照片），而用人单位拒不提供的，可以推定劳动者主张成立。
- 在这种情况下，举证责任倒置给用人单位，即用人单位需要承担未能提供证据的不利后果。
违法解除/终止劳动合同的争议：
- 在用人单位作出的开除、除名、辞退、解除劳动合同等决定而发生的劳动争议中，举证责任也倒置给用人单位。
- 用人单位需要证明其解除劳动合同的合法性，包括证明解除依据的规章制度合法有效、程序合规（如工会通知）、事实依据充分（如违纪行为调查记录）等。
三、实务建议
劳动者：
- 在维权过程中，应积极搜集和保留所有与劳动关系相关的证据，包括书面材料、电子数据等。
- 注意证据的合法性和有效性，确保能够形成完整的证据链。
- 离职时要求用人单位出具书面离职证明，并注明入职/离职日期及岗位，以便在后续争议中作为证据使用。
用人单位：
- 应建立健全的人事管理制度，确保所有员工的入职、离职、薪资支付等信息都有明确的记录和存档。
- 在面临劳动争议时，能够及时、准确地提供相关证据，以避免不必要的法律风险。
- 对于涉及员工切身利益的决策（如解除劳动合同），应确保程序合规、事实依据充分，并保留好相关证据。
综上所述，劳动关系的举证责任分配是一个复杂而细致的问题。在实际操作中，应根据具体情况进行灵活处理，确保双方的权益得到公正、合理的保护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。