关于公司让签协议待岗两年后，补偿按待岗前还是待岗后工资算的问题，这主要取决于具体的协议内容以及相关法律法规的规定。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 协议内容是关键：

   • 如果协议中明确规定了待岗期间的工资待遇以及待岗结束后的补偿计算方式，那么应当按照协议中的约定来执行。这是基于合同自由原则，即双方当事人在不违反法律法规的前提下，可以自由约定合同的内容。
   • 如果协议中没有明确规定补偿的计算方式，或者规定不明确，那么就需要依据相关法律法规来确定。

2. 相关法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，待岗期间的工资待遇通常应不低于当地最低工资标准。但这并不直接决定待岗结束后的补偿计算方式。
   • 在计算经济补偿时，一般是以劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资为基数。然而，如果待岗期间工资明显低于正常工作期间的工资，且待岗并非劳动者原因造成，那么以待岗期间工资作为计算基数可能显失公平。
   • 在这种情况下，劳动者可以主张以待岗前的正常工资水平作为计算经济补偿的基数。但这一主张需要得到劳动仲裁机构或法院的支持，具体取决于案件的具体情况和证据。

3. 实际操作中的建议：

   • 在签订待岗协议时，务必仔细阅读协议内容，特别是关于工资待遇和补偿计算方式的条款。如有不明确或不合理之处，应及时与公司沟通并协商修改。
   • 如果待岗期间或待岗结束后与公司就补偿问题产生争议，建议首先与公司进行协商解决。协商不成的，可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
   • 在处理此类争议时，劳动者应保留好相关证据，如待岗协议、工资单、工作记录等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的主张。

总结来说，待岗两年后的补偿计算方式并非固定不变，而是取决于协议内容以及相关法律法规的规定。在签订协议时务必谨慎，并在产生争议时及时寻求法律帮助。如果你有任何进一步的疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。