当您申请工伤认定，但劳动部门不予受理时，您可以按照以下步骤来处理这个问题：

一、了解不予受理的原因

首先，您需要明确劳动部门不予受理的具体原因。这通常会在不予受理决定书中明确说明。可能的原因包括但不限于：

1. 申请超时：根据《工伤保险条例》的规定，职工或其近亲属应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。如果超出这个时限，且没有正当理由，劳动部门将不予受理。

2. 不属于管辖范围：如果您的用人单位注册地与生产经营地不在同一统筹地区，或者您未在正确的地区申请工伤认定，劳动部门也可能不予受理。

3. 申请材料不完整：根据《工伤保险条例》的要求，您需要提交完整的工伤认定申请材料，包括工伤认定申请表、劳动关系证明材料和医疗诊断证明等。如果材料不完整，劳动部门会要求您补正，如果您未能按要求补正，则可能不予受理。

4. 申请人不具备申请资格：只有职工所在单位、职工本人及其近亲属、工会组织才有资格提出工伤认定申请。如果您不属于这些范围，劳动部门将不予受理。

5. 被申请单位与劳动者不存在劳动关系：工伤认定通常以劳动关系的存在为基本前提。如果劳动部门认为您与被申请单位不存在劳动关系，且不属于特定情形（如违法发包、转包等），则可能不予受理。

二、根据原因采取相应措施

1. 如果申请超时：

   • 检查是否有正当理由导致逾期，如不可抗力、人身自由受到限制、属于用人单位原因等。
   • 如果有正当理由，可以向劳动部门说明情况，并申请顺延申请期限。

2. 如果不属于管辖范围：

   • 确认正确的申请地区，通常是用人单位注册地或生产经营地。
   • 向正确的劳动部门重新提交工伤认定申请。

3. 如果申请材料不完整：

   • 根据劳动部门的书面告知，补正所有需要的材料。
   • 确保补正的材料真实、完整、有效。

4. 如果申请人不具备申请资格：

   • 确认自己是否属于有资格提出工伤认定申请的范围。
   • 如果不属于，可以尝试通过其他途径（如委托近亲属或工会组织）提出申请。

5. 如果被申请单位与劳动者不存在劳动关系：

   • 确认是否存在特定情形（如违法发包、转包等），这些情形下即使不存在劳动关系也可以申请工伤认定。
   • 如果不存在特定情形，且您认为与被申请单位存在劳动关系，可以先通过劳动仲裁或诉讼确认劳动关系。

三、申请行政复议或提起行政诉讼

如果您认为劳动部门的不予受理决定错误，且您已经采取了上述措施但问题仍未解决，您可以根据《工伤保险条例》第五十五条第(一)项和《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，向区人民政府或市人力资源和社会保障局申请行政复议，或者依法向人民法院提起行政诉讼。

四、寻求专业帮助

在处理这类问题时，如果您感到困惑或不确定如何操作，建议寻求专业律师或法律援助机构的帮助。他们可以提供更具体、更专业的法律建议和指导。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。