结论：在永久基本农田上建房并取得房产证，这一行为通常是不合法的。

分析：

1. 永久基本农田的法律地位：

   • 永久基本农田是依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地，受到法律的严格保护。根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，任何单位和个人不得擅自改变基本农田的用途，不得在基本农田上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。

2. 建房行为的合法性：

   • 在永久基本农田上建房，明显违反了土地管理法的规定，属于非法占用农用地的行为。即使建房者后续取得了房产证，这也不能改变其建房行为的非法性。因为房产证的颁发应当基于合法的土地使用权和建设行为，而非法占用农用地建房并不满足这一前提。

3. 房产证的效力问题：

   • 房产证是房屋所有权的法律凭证，但其颁发必须基于合法的土地和建设行为。如果建房行为本身非法，那么即使取得了房产证，该证书也可能因建房行为的非法性而被撤销或宣告无效。此外，相关部门在发现非法占用农用地建房的行为后，有权依法进行查处，包括拆除违法建筑、恢复土地原状等。

4. 可能的法律后果：

   • 对于非法占用农用地建房的行为，相关部门将依法进行处罚，包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等。同时，还可能对建房者处以罚款等行政处罚。如果情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

建议：

• 如果您已经在永久基本农田上建房并取得了房产证，建议您尽快咨询当地土地管理部门或法律专业人士，了解具体的法律后果和解决方案。
• 在未来的土地使用和建设行为中，请务必遵守相关法律法规的规定，确保土地和建设行为的合法性。

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