在农村，利用基本农田建造的房屋，无论经过多少年，都不会自动变得合法。这是因为基本农田受到严格的法律保护，任何未经批准擅自改变其用途的行为都是违法的。以下是对这一问题的详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，国家实行土地用途管制制度，严格限制农用地转为建设用地。基本农田作为农用地的重要组成部分，其保护尤为严格。未经依法批准，任何单位和个人不得擅自占用基本农田进行非农业建设，包括建造房屋。

法律后果

1. 拆除与恢复：对于未经批准在基本农田上建造的房屋，相关部门有权责令拆除，并恢复土地原状。这意味着，即使房屋已经存在多年，一旦被发现违法，仍可能面临被拆除的风险。
2. 罚款与处罚：除了拆除房屋外，违法者还可能面临罚款等行政处罚。罚款的数额根据违法情节的严重程度而定，可能包括房屋价值的一定比例或其他相关费用。
3. 刑事责任：在极端情况下，如果违法占用基本农田的行为情节严重，构成犯罪的，还可能依法追究刑事责任。

特殊情况与建议

1. 历史遗留问题：虽然法律对基本农田的保护非常严格，但在某些特殊情况下，如历史遗留问题或政策调整等，可能存在一定的处理空间。然而，这并不意味着违法建筑可以自动合法化，而是需要依据相关政策或法律程序进行妥善处理。
2. 合法途径：如果您确实需要在农村建造房屋，建议首先了解当地的土地政策和规划要求，确保所选地块符合建设用地的条件。然后，按照法定程序申请建设用地批准手续，获得合法的建设许可后再进行建设。

后续行动建议

1. 立即停止违法行为：如果您已经在基本农田上建造了房屋，且尚未获得合法的建设许可，建议立即停止违法行为，并咨询当地土地管理部门或律师，了解后续处理方案。
2. 积极配合调查：如果相关部门已经发现了您的违法行为，并展开了调查，建议积极配合调查工作，如实说明情况，并主动采取措施消除违法状态。

总之，利用基本农田建造房屋是违法的，且不会因时间的推移而自动合法化。如果您有在农村建造房屋的需求，请务必遵守相关法律法规和政策要求，确保合法合规地进行建设。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。