农民建房3年并不能直接认定为合法，其合法性需根据具体情况及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、合法建房的基本条件

1. 符合规划：农民建房必须符合当地土地利用总体规划和村庄规划。若建房地点不符合规划要求，即使建房多年，也可能被认定为违法建筑。
2. 取得许可：根据《土地管理法》及相关规定，农民建房需取得乡村建设规划许可证和宅基地使用权证。未取得相关许可的建房行为，属于违法建设。
3. 符合面积标准：农民建房的面积需符合当地规定的标准。超出标准的部分，可能被视为违法建筑。

二、建房3年后的合法性判断

1. 若建房时已取得合法手续：

   • 若农民在建房时已依法取得乡村建设规划许可证和宅基地使用权证，且建房符合规划要求和面积标准，则该房屋自建成之日起即具有合法性，不受建房时间长短的影响。

2. 若建房时未取得合法手续：

   • 若农民在建房时未取得相关许可，或建房不符合规划要求和面积标准，则该房屋属于违法建筑。即使建房多年，也不能因此获得合法性。
   • 对于此类违法建筑，相关部门有权依法进行查处，包括责令限期拆除、罚款等措施。

三、特殊情况下的合法性认定

1. 历史遗留问题：对于因历史原因形成的无证房屋，若符合当地政策规定，可能通过补办手续等方式获得合法性。但这一过程需遵循相关法律法规和政策要求。
2. 政策变化：若建房时符合当时政策规定，但后续政策发生变化导致房屋不再符合要求，需根据新政策进行判断。一般情况下，政策变化不溯及既往，但具体需根据当地政策执行情况确定。

四、法律建议

1. 核查手续：农民在建房前应确保已取得相关许可，并符合规划要求和面积标准。若已建房多年但未取得合法手续，建议尽快向相关部门咨询并补办手续。
2. 关注政策变化：农民应关注当地政策变化，确保房屋持续符合政策要求。若政策发生变化导致房屋不再符合要求，应及时采取措施进行整改。
3. 咨询专业律师：若对房屋合法性存在疑问或面临查处风险，建议咨询专业律师以获取法律帮助。

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