结论：在关联企业混同用工的情况下，原公司发放自身岗位工资而新公司不发工资的行为，其合法性需根据具体情况判断，一般而言，若新公司未与员工建立合法有效的劳动关系或未履行工资支付义务，则不发工资的行为不合法。以下从不同角度进行详细分析：
一、关联企业混同用工的法律性质
关联企业混同用工，通常指的是两个或两个以上的关联企业，在用工过程中存在人员、业务、财务等方面的交叉或混同，导致劳动者难以区分其实际用工主体。在这种情况下，劳动者可能与多家关联企业均存在事实上的劳动关系，或者与其中一家企业建立劳动关系，但为其他关联企业提供劳动。
二、工资支付义务的法律基础
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是用人单位的基本义务，也是劳动者的基本权利。
三、新公司不发工资的合法性分析
若新公司与员工未建立劳动关系：
- 如果新公司并未与员工签订劳动合同，也未实际用工，那么新公司自然没有工资支付义务。但在此情况下，若员工实际上是在为新公司提供劳动，而新公司未支付工资，则可能构成非法用工或拖欠工资，员工有权向原公司或新公司（如能证明实际用工关系）主张工资支付。
若新公司与员工建立了劳动关系但未支付工资：
- 如果新公司与员工已经建立了劳动关系，但未按照劳动合同约定或国家规定支付工资，那么新公司的行为显然是不合法的。员工有权要求新公司支付拖欠的工资，并可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
关联企业混同用工下的特殊情况：
- 在关联企业混同用工的情况下，如果员工难以区分其实际用工主体，或者多家关联企业均对员工的劳动进行了管理和支配，那么员工可能有权向其中任何一家关联企业主张工资支付。此时，如果新公司作为实际用工主体之一而未支付工资，其行为同样是不合法的。
四、法律建议
对于员工而言：
- 首先应明确自己的劳动关系归属，即与哪家企业签订了劳动合同或存在事实上的劳动关系。
- 如果新公司未支付工资，且员工认为新公司是实际用工主体之一，可以收集相关证据（如工作记录、考勤记录、工资条等）向新公司主张工资支付。
- 如果新公司拒绝支付或无法联系到新公司，员工可以向原公司或劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于企业而言：
- 应规范用工管理，明确劳动关系归属，避免混同用工带来的法律风险。
- 如果确实存在混同用工的情况，应与员工明确约定工资支付主体和方式，并确保按时足额支付工资。
- 在发生工资支付纠纷时，应积极与员工协商解决，避免矛盾升级和法律风险扩大。
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