关联企业代发工资在特定条件下是合法的。具体分析如下：

1. 合法条件：

   • 关联公司与员工所在公司之间存在合法的委托代发协议。
   • 代发行为需符合相关法律法规及合同约定，确保工资数额的准确性、按时发放，不得克扣或拖欠工资。
   • 应保障员工的合法权益，如工资构成、福利待遇等应与原公司规定一致。

2. 可能存在的风险：

   • 若无合理借口与合法程序，滥用关联公司发放工资，可能引起薪酬支付紊乱，损害劳动者权益。
   • 如干扰社保缴纳，可能牵扯劳动纠纷中的责任归属问题，进而产生违法风险。

3. 实际判断：

   • 实际是否合法，需结合多种因素及相关证据予以判定，如代发协议的合法性、代发行为的合规性、员工权益的保障情况等。

综上所述，关联企业代发工资并非必然违法，但需满足特定的法律条件和程序。若您或您的公司面临此类情况，建议详细咨询专业律师，以确保代发行为的合法性和合规性。作为晏小利律师，我专注于劳动纠纷等领域，如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。