施工方永久占用农民土地耕地，必须依法取得合法手续，否则属于违法行为，不存在所谓“需要补办的手续”来直接使非法占用行为合法化。以下从合法手续的办理流程、非法占用的法律后果、农民的维权途径三个角度详细说明：

一、合法手续的办理流程（若需合法占用）

若施工方确需永久占用农民土地耕地，必须依法办理以下手续，缺一不可：

1. 土地征收审批

   • 根据《土地管理法》第44-47条，占用耕地需由省级以上人民政府批准征收，并纳入土地利用年度计划。
     
   • 流程包括：发布征收预公告、开展土地现状调查、组织社会稳定风险评估、拟定征地补偿安置方案、签订补偿协议、报批征收申请、发布征收公告等。
     
   • 关键点：必须由县级以上人民政府组织实施，施工方无权直接征收土地。

2. 农用地转用审批

   • 若占用耕地属于农用地，需先办理农用地转用审批（由国务院或省级政府批准）。
     
   • 需提交项目可行性研究报告、土地利用总体规划图、补充耕地方案等材料。

3. 供地手续

   • 征收完成后，土地所有权转为国有，施工方需通过招标、拍卖、挂牌或协议出让方式取得国有土地使用权，并签订《国有建设用地使用权出让合同》。
     
   • 需缴纳土地出让金、契税等费用。

4. 规划许可与施工许可

   • 取得土地使用权后，还需办理《建设用地规划许可证》《建设工程规划许可证》《建筑工程施工许可证》等，方可开工建设。

二、非法占用的法律后果

若施工方未办理上述手续即永久占用土地，可能面临以下法律责任：

1. 行政责任

   • 根据《土地管理法》第77条，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还土地，没收违法所得，并处罚款（按占用耕地面积处每平方米100元以上1000元以下罚款）。
     
   • 对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分。

2. 刑事责任

   • 若非法占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上，可能构成《刑法》第342条规定的“非法占用农用地罪”，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

3. 民事赔偿

   • 施工方需赔偿农民因土地被占用导致的损失，包括土地收益损失、青苗补偿费、地上附着物补偿费等。

三、农民的维权途径

若发现施工方非法占用土地，农民可采取以下措施：

1. 向自然资源部门举报

   • 拨打12336全国自然资源违法举报电话，或向当地县级自然资源主管部门提交书面举报材料，要求查处违法行为。

2. 申请行政复议或提起行政诉讼

   • 若对政府征收行为不服，可在知道征收决定之日起60日内申请行政复议，或在6个月内提起行政诉讼。

3. 要求民事赔偿

   • 通过协商、调解或诉讼方式，要求施工方赔偿损失。需保留土地承包合同、土地现状照片、损失计算依据等证据。

总结：施工方永久占用农民土地耕地必须依法办理征收、转用、供地等手续，未经批准占用属于违法行为。农民可通过举报、复议、诉讼等途径维护权益，并要求赔偿损失。若您遇到此类问题，可直接向我咨询具体操作流程和证据收集方法。