结论：因病手术单位扣工资一般是不合理的，但具体还需根据实际情况判断，如是否属于医疗期、单位规章制度是否合法等。

详细分析：

1. 医疗期内的工资支付：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
   • 在医疗期内，企业应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或者疾病救济费，具体标准由各地根据实际情况确定。因此，如果员工处于医疗期内，单位扣工资是不合理的。

2. 医疗期外的工资支付：

   • 医疗期满后，如果员工仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。
   • 在医疗期满后，如果员工能够继续工作，但单位以手术为由扣工资，这通常也是不合理的，除非单位有合法的规章制度且该制度已经向员工公示或告知，同时该制度不违反法律法规的强制性规定。

3. 单位规章制度的合法性：

   • 如果单位有规章制度规定，员工因病手术需要扣减工资，那么需要审查该规章制度是否合法。根据《劳动合同法》的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
   • 如果单位的规章制度未经上述程序制定，或者规章制度的内容违反法律法规的强制性规定，那么该规章制度对员工不具有约束力，单位不能依据该规章制度扣减员工工资。

建议：

• 如果员工认为单位扣工资不合理，可以先与单位进行沟通协商，了解扣工资的具体原因和依据。
• 如果沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 在处理此类纠纷时，员工应保留好相关证据，如医疗证明、工资单、单位规章制度等，以便在需要时提供证明。

可能后果：

• 如果单位扣工资的行为被认定为违法，单位可能需要补发工资、支付经济补偿金或者赔偿金等。
• 同时，单位还可能面临劳动监察部门的处罚或者劳动仲裁机构的裁决不利等后果。

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