合作公司可通过以下途径追回员工承诺的赔偿，但需根据具体法律关系和证据情况选择合适方式：

1. 若员工构成表见代理或职务行为，可直接起诉员工所在公司

   • 法律依据：根据《民法典》第170条（职务代理）、第172条（表见代理），若员工在签署赔偿承诺时具有公司授权外观（如工牌、合同章、明确职务身份），或合作公司有理由相信其有权代表公司承诺赔偿（如长期业务对接人），则公司需承担法律后果。
     
   • 操作建议：收集员工在职证明、授权文件、过往交易记录等证据，证明其行为构成职务行为或表见代理，直接起诉公司要求履行赔偿。

2. 若员工无代理权，需以员工个人为被告追责

   • 法律依据：若员工无公司授权（如私自承诺、超越职权范围），且合作公司明知或应知其无权，则赔偿承诺仅对员工个人有效，公司无需承担责任。
     
   • 操作建议：
     
     • 民事诉讼：起诉员工个人，要求其依据《民法典》第1165条（侵权责任）或第577条（违约责任）赔偿损失。需提供赔偿承诺书、员工签字文件、实际损失证明（如合同违约金、直接经济损失）等证据。
       
     • 刑事报案：若员工涉嫌诈骗（如虚构公司授权、伪造公章），可向公安机关报案，追究其刑事责任，同时通过刑事附带民事诉讼追偿。

3. 若公司事后追认员工行为，可要求公司履行

   • 法律依据：根据《民法典》第140条，若公司以书面或行为方式明确表示接受员工承诺的赔偿（如签署补充协议、实际支付部分款项），则构成追认，公司需承担责任。
     
   • 操作建议：收集公司追认的证据（如邮件、聊天记录、付款凭证），直接起诉公司要求履行赔偿。

关键风险提示：

• 合作公司需在诉讼时效内主张权利（一般为3年，自知道或应当知道权利受损之日起算）。
  
• 若赔偿承诺涉及公司利益，需确保员工行为未违反公司章程或内部规定（如高管越权担保需股东会决议），否则可能因“无权处分”导致承诺无效。
  

建议行动步骤：

1. 立即固定证据（赔偿承诺书、员工身份证明、公司授权文件、损失计算依据）；
   
2. 委托律师分析员工行为是否构成职务代理或表见代理；
   
3. 根据证据情况选择起诉公司、员工个人或同时起诉，并申请财产保全防止转移资产。
   

如有进一步细节（如赔偿承诺形式、员工职务、公司是否知情等），可提供具体信息以便更精准分析。