行政诉讼中，不适用合法性审查原则的案件主要包括涉及国家秘密、个人隐私和法律另有规定的案件。以下是对这一结论的详细解释：
涉及国家秘密的案件：
- 解释：国家秘密关乎国家安全和利益，其保密性至关重要。在行政诉讼中，如果案件涉及国家秘密，为了维护国家安全，通常不会对这类案件进行公开的合法性审查。
- 法律依据：虽然具体的法律条文可能并未直接说明涉及国家秘密的案件不适用合法性审查原则，但根据《中华人民共和国保守国家秘密法》等相关法律的规定，国家秘密的保密性要求决定了这类案件在诉讼程序上的特殊性。
涉及个人隐私的案件：
- 解释：个人隐私是每个人的基本权利，受到法律的保护。在行政诉讼中，如果案件涉及个人隐私，如个人身份信息、健康状况、家庭关系等，为了保护当事人的隐私权，通常不会对这类案件进行公开的合法性审查，或者会采取相应的保密措施。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于隐私权保护的规定，以及《中华人民共和国行政诉讼法》中关于保护当事人合法权益的原则，涉及个人隐私的案件在诉讼过程中需要特别保护。
法律另有规定的案件：
- 解释：除了涉及国家秘密和个人隐私的案件外，还有一些特定类型的案件，法律可能另有规定不适用合法性审查原则。这些规定可能基于案件的特殊性、政策考虑或其他法律原则。
- 举例：例如，某些涉及外交、国防等特殊领域的行政案件，可能由于涉及国家重大利益或外交关系，而不被纳入合法性审查的范围。此外，一些法律可能明确规定某些类型的行政行为（如某些行政指导行为）不受司法审查，这也意味着这些案件不适用合法性审查原则。
额外说明：
- 在行政诉讼中，合法性审查原则是核心原则之一，它确保了行政权力的合法行使和公民、法人及其他组织合法权益的保护。然而，这一原则并非绝对适用，上述三类案件就是例外。
- 对于不适用合法性审查原则的案件，法院可能会采取其他审查方式或程序来保障当事人的合法权益，如不公开审理、保密处理等。
建议：
- 如果您面临涉及上述特殊类型的行政诉讼案件，建议及时咨询专业律师，以了解具体的法律程序和权利保障措施。
- 在行政诉讼过程中，无论案件是否适用合法性审查原则，都应积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和材料，以维护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。