结论：非法经营员工工资是否算赃款，主要取决于员工的知情程度、参与程度以及工资与非法经营活动的关联性。具体来说：

1. 员工不知情且未参与非法活动：

   • 若员工对公司的非法经营活动毫不知情，仅是在正常履行工作职责后获取工资报酬，那么这部分工资通常不被认定为赃款。因为员工主观上没有参与非法经营的故意，是基于合法的劳动付出而获得相应收入，与非法经营活动的本质没有直接关联。
   • 法律背景：根据法律原则，赃款是指通过非法手段获得的财物或资金。在员工不知情且未参与非法活动的情况下，其工资并非通过非法手段获得，因此不构成赃款。

2. 员工知情并参与非法活动：

   • 若员工明知公司从事非法经营活动，仍然积极参与其中，并且其工资收入与非法经营活动直接关联，那么这部分工资可能会被认定为赃款。因为员工在这种情况下实际上是在协助或参与非法活动，并从中获利，其工资成为了非法经营所得的一部分。
   • 法律背景：在司法实践中，法院会综合考虑员工的工作内容、在非法经营活动中所起的作用、对非法经营行为的认知程度和参与程度等因素，来判断员工的工资是否构成赃款。如果员工明知并参与非法活动，且工资与非法收益存在紧密关联，那么这部分工资很可能被认定为赃款。

3. 司法实践中的判断标准：

   • 法院在判断员工工资是否为赃款时，会综合考虑多种因素，包括但不限于员工的知情程度、参与程度、工资数额的合理性、非法经营活动的性质和严重程度等。
   • 具体考量：例如，员工的工作内容是否涉及非法经营活动的核心环节；员工在非法经营活动中所起的作用是辅助性还是决定性；员工对非法经营行为的认知程度是明知还是不知情；工资来源的合法性及其与非法经营收益的关联性；员工是否能证明自己未参与违法行为或对违法经营不知情等。

法律建议：

• 对于员工而言，如果发现自己所在的公司存在非法经营活动，应立即停止参与，并尽快向相关部门举报。同时，保留好与公司的劳动合同、工资发放记录等证据，以证明自己的清白和工资的合法性。
• 如果员工因公司非法经营活动而面临法律纠纷，应积极配合司法机关的调查，如实陈述事实，提供相关证据，以维护自己的合法权益。
• 对于企业和雇主而言，应严格遵守法律法规，合法经营，避免给员工带来不必要的法律风险和经济损失。如果企业存在非法经营活动，应及时整改，并承担相应的法律责任。

可能法律后果：

• 如果员工的工资被认定为赃款，可能会面临被追缴的风险，同时可能因参与非法经营活动而受到行政处罚或刑事处罚。
• 如果企业存在非法经营活动，除了可能面临罚款、没收违法所得等行政处罚外，还可能因构成犯罪而受到刑事处罚，同时企业的相关责任人员也可能面临刑事责任。