结论：有工作记录但没有打卡被扣工资的情况，您可以先尝试与用人单位协商解决；若协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 协商解决：

   • 情况说明：首先，您可以与用人单位进行沟通，说明自己虽然未打卡，但确实有实际的工作记录，如工作成果、同事证明、邮件往来等，以证明自己的工作情况。
   • 建议：在协商过程中，保持冷静和理性，明确表达自己的诉求，即要求用人单位补发被扣的工资。同时，也可以提出改进打卡制度的建议，以避免类似情况再次发生。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 法律依据：根据《劳动保障监察条例》的相关规定，劳动保障行政部门对用人单位遵守劳动保障法律、法规或者规章的情况进行监察，对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，有权依法予以纠正和处罚。
   • 操作流程：如果您与用人单位协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉。投诉时，需要提供相关的工作记录、工资条、打卡记录（如有）等证据材料，以证明用人单位存在违法扣减工资的行为。
   • 可能结果：劳动监察部门在受理投诉后，会进行调查核实。如果确认用人单位存在违法行为，会责令其限期改正，并可能处以罚款等行政处罚。同时，您也有权要求用人单位补发被扣的工资。

3. 申请劳动仲裁：

   • 法律依据：根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 操作流程：如果您对劳动监察部门的处理结果不满意，或者用人单位拒绝执行劳动监察部门的决定，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。申请仲裁时，需要提交仲裁申请书、相关证据材料等。
   • 可能结果：劳动争议仲裁委员会在受理仲裁申请后，会进行开庭审理，并根据事实和法律规定作出裁决。如果裁决支持您的诉求，用人单位需要按照裁决结果补发被扣的工资。如果用人单位不履行裁决结果，您还可以向人民法院申请强制执行。

额外建议：

• 保留证据：在处理此类纠纷时，保留好相关的工作记录、工资条、打卡记录（如有）、同事证明等证据材料非常重要。这些证据将有助于您证明自己的工作情况和用人单位的违法行为。
• 了解法律：建议您在处理此类纠纷前，先了解一下相关的劳动法律法规，以便更好地维护自己的合法权益。
• 及时行动：如果您发现自己的工资被违法扣减，应及时采取行动，避免超过法定的申诉时效。

后续思考：

• 在未来的工作中，建议您尽量遵守用人单位的打卡制度，以避免因未打卡而引发的纠纷。
• 如果用人单位的打卡制度存在不合理之处，您可以与用人单位进行沟通协商，提出改进建议。
• 如果您在处理此类纠纷过程中遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。